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DNA酶解及DNA片段琼脂糖凝胶电泳

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【目的要求】1. 掌握限制性核酸内切酶概念、特点及作用原理,DNA酶解技术的应用2. 掌握琼脂 糖凝胶电泳分离DNA片段原理及其操作3. 熟悉电泳基本原理及其影响因素【教学内容】1.限制性核酸内切酶概念、特点及作用原理,DNA酶解技术的应用2.DNA片段琼脂糖凝胶电泳3.电泳概念、分类、应用、基本原理及其影响因素, 琼脂糖凝胶制备、加样、电泳及结果分析【实验】一.DNA酶解原理:1.限制性核酸内切酶:是一类能识别并水解双链DNA中特定碱基顺序的核酸水解酶。一般能识别4-6个碱基对,并在特定位点切割。如:HindⅢ A↓A G C T T EcoRⅠ G↓A A T T C HpuⅡ C↓C G G2.酶单位数:在最适温度、PH条件下,1小时完全水解1μgλDNA所需的酶量为1个单位。试剂:(1)λDNA(0.38μg/μl) (2) HindⅢ (16u/μl)(3) 酶解Buffer(Tris-HCl,NaCl,MgCl2,DTT )(4) 反应终止液(溴酚蓝1%,SDS 1%,EDTA 2%,甘油50%) 方法:1. 取两只EP管(1)λDNA 10μl,双蒸水 10μl (2)λDNA 10μl,HindⅢ 10μl 充分混匀 2. 37℃水浴2小时。 3. 保温结束后加入终止液5μl。二. 琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段(水平潜水式)原理:1. DNA含有PO43-基团,在pH7.5 Buffer中带负电, 在电场中向正极移动。由于不同大小的DNA片段的电荷密度大致相同,自由电泳时,各核酸分子的迁移率区别很小,难以分开2. 选用适当浓度的凝胶作为支持物,使之具备一定的孔径,即可发挥分子筛效应(凝胶孔径对大小不同的分子有不同的阻力),使大小不同的核酸片段迁移率出现较大差异,达到分离的目的,同样条件对Maker电泳,对比观察DNA酶解效果3. DNA经溴乙锭(EB)染色,溴乙锭可以插入DNA双螺旋结构两个碱基之间,与核酸形成络合物,在紫外(300nm,360nm)激发下,产生桔黄色荧光(590 nm可见光)。标准Maker经溴乙锭(EB)染色可以观察到6条带,分别为: 23Kb, 9.9Kb, 4.4Kb, 4.3Kb, 2.2Kb, 2.0Kb试剂:(1)1%琼脂糖(2)TAE液(3)Marker(4)EB 方法:1. 电泳仪接线:黑(负)—黑,红(正)—红2.凝胶槽准备:用胶布固定胶槽两侧,调整梳子高度距离槽底2-3毫米,调好水平。3.灌胶:(1) 称取0.8克琼脂糖,加入80毫升TAE中,热浴溶解至透明(2) 60℃左右加入EB100μl(终浓度0.5μg/ml), 倒入备好的凝胶槽中。应注意胶面平整,无气泡(3) 冷却后,拔去梳子4.加样: (1) 去掉胶布,将灌好的胶板平放在电泳槽中 (2) 加入电极Buffer使之高出胶面(1-3毫米) (3) 用进样器吸样品20μl加入样品槽中5.电泳: v = 100V, 1-1.5小时,至溴酚蓝移出2/36.观察: (戴手套)紫外灯下(254-365nm), 暗处观察, 记录。可见DNA橙红色区带【注意事项】1.在EP管加入试剂时要用漩涡混合器混合后离心。2.琼脂糖凝胶电泳时加样侧应位于负极端。3.溴乙锭可引起基因突变,操作时要注意个人防护。4.紫外光对人眼有害,观察时加盖玻璃罩,观察时间不宜太长。
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