丁香实验_LOGO
登录
提问
我要登录
|免费注册
点赞
收藏
wx-share
分享

DNA片段的琼脂糖凝胶电泳

互联网

1728
相关专题
 
【原 理】
琼脂 糖凝胶电泳是重组DNA研究中常用的技术,可用于分离,鉴定和纯化DNA片段。不同大小、不同形状和不同构象的DNA分子在相同的电泳条件下(如凝胶浓度、电流、电压、缓冲液等),有不同的迁移率,所以可通过电泳使其分离。凝胶中的DNA可与荧光染料溴化乙锭(EB)结合,在紫外灯下可看到荧光条带,籍此可分析实验结果。

【操作步骤】
1、将凝胶成形模具两端用医用胶布封好,水平放置,将选好的梳子放好,梳子底部与模具之间留1mm空间。
2、称取DNA电泳用琼脂糖0.8g放入250ml的三角烧杯中,加入100ml 1×TAE缓冲液,混匀后,将烧瓶置于电炉上,加热煮沸,直至琼脂糖完全溶解。
3、关闭电炉,取下三角烧瓶,将其置室温下冷却至70℃左右(手握烧瓶可以耐受),再加入溴化乙锭(10mg/ml)5μl,混匀后,即将凝胶溶液倒入胶板铺板。本实验所用制胶板约需胶液100ml。
4、室温下待凝胶完全凝固,需时约30分钟,揭去二端胶布,拔出梳齿,将胶板放入电泳槽 中。
5、在电泳槽中加入1×TAE缓冲液,以高出凝胶表面2mm为宜。
6、取EP管三支,标号,如下表所示准备电泳样品。

 

1

2

3

样品

λDNA/HindⅢ

未酶解质粒

酶解质粒

 

10μl(lr)

10μl(~2r)

10μl(~2r)

6×点样液

2μl

2μl

2μl

7、将上面三管样品置震荡器上混匀,短暂离心。
8、用加样器吸取样品。依次分别加入三个点样孔中,注意加样器吸头应恰好置于凝胶点样孔中,不可刺穿凝胶,也要防止将样品溢出孔外。
9、接通电源,调节电压至50伏,电泳90分钟后,将凝胶板取出,在紫外灯下观察结果。
注:1、细菌噬菌体DNA全长49.01kb,其序列及酶切位点已研究清楚,它经不同的限制性内切酶消化后可产生不同的电泳带图谱。因为每条区带的DNA长度是已知的,所以被选为基因工程中常用的DNA分子大小标准,与其进行比较计算,即可得到待测DNA片段的长度,λDNA经HindⅢ消化后产生7条区带,依次为23.7;9.46;6.75;4.26;2.26;1.98;0.58(kb)。
2、溴化乙锭为一种有毒试剂,使用时一定要戴手套操作,注意防护。
【仪器与器材】
1、电泳仪
2、水平式核酸电泳槽
3、紫外灯
【试剂与材料】
1、琼脂糖
2、6×点样缓冲渡:0.25%溴酚兰、40%蔗糖
3、DNA分子量标准:λDNA分子量标准:λDNA/HindⅢ
4、50×TAE电泳缓冲液贮存液配方:(50×)每升
242g Tris
57.1ml 冰醋酸
100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)
1×缓冲液浓度:0.04mol/L Tris HAc、0.002mol/L EDTA
5、0.8%琼脂糖:0.8g琼脂糖用100ml 1×TAE沸水浴溶解
6、10mg/ml EB 1.0g 溴乙锭
100ml 三蒸水
【附 注】
影响DAN片段琼脂糖电泳的几个因素:
1、DNA分子的大小:线性DNA分子的迁移率与其分子 量的对数值成反比。
2、琼脂糖浓度:一定大小的DNA片段在不同浓度的琼脂糖凝胶中的迁移率是不相同的。相反,在一定浓度的琼脂糖凝胶中,不同大小的DNA片段的迁移率也是不同的。若要有效地分离不同大小的DNA,应采用适当浓度的琼脂糖凝胶。

琼脂糖凝胶浓度

可分辨的线性DNA片段大小(kb)

0.4

5~60

0.7

0.8~10

1.0

0.4~6

1.5

0.2~4

1.75

0.2~3

2.0

0.1~3

琼脂糖凝胶浓度

可分辨的线性DNA片段大小(kb)

3、DNA分子的形态:在同一浓度的琼脂糖凝胶中,超螺旋DNA分子迁移率比线性DNA分子快,线性DNA分子比开环DNA分子快。
4、电流强度:每厘米凝胶电压不超过5V,若电压过高分辨率会降低,只有在低电压时,线性DNA分子的电泳迁移率与所用电压成正比。
提问
扫一扫
丁香实验小程序二维码
实验小助手
丁香实验公众号二维码
扫码领资料
反馈
TOP
打开小程序