芯片常见问题分析

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1 芯片实验和定量PCR 的优劣比较?
　　基因表达 谱芯片实验可以对大量基因一次性进行定量研究,定量PCR则对大量基因需逐一进行定量研究。
2 在芯片制作过程中的PCR原液是否可以为客户保存?
　　可以抽干冷冻保存一年。
3 可否用DNA和芯片杂交?
　　不可以，因为芯片上的样品是cDNA而真核基因DNA中普遍存在內显子，核酸杂交无法顺利进行。
4 对于临床症状不明显的的遗传病,如何取样?
　　可以从病人抽取血样或者骨髓。
5 如何保存血样?
　　将血样中血细胞分离出来，然后-80℃低温保存。
6 脱落细胞是否都是死亡的细胞, 其中是否可以抽提mRNA?
　　不完全是死亡的细胞, 但是mRNA的含量比较少, 建议最好用正常细胞抽提mRNA。
7 完成一张芯片的实验,需要的细胞的量是多少?
　　需要5×106的细胞量
8 提供的电泳图和OD值如何评价mRNA的质量？
　　电泳图可以分析mRNA和总RNA是否降解, OD值可以判断纯度。
9 是否可以将同一症状的病例混合后抽提,看共性表达?
　　可以。

10 芯片是否可以重复使用?
　　不可以。
11 杂交后的芯片如何保存?
　　避光常温保存几个星期。
12 在实验前期,如何定参照物?
　　根据实验设计来确定使用共同参照物还是各自的参照物。
13 如何消除基因芯片 实验中的个体差异？
　　可以使用同一样品重复芯片实验,取其共性,获得可靠的数据结果。
14 芯片在杂交过程中为什么会发生非特异性杂交, 如何降低?
　　这是由于DNA碱基错配造成, 提高芯片杂交后洗脱液的温度可以降低非特异性杂交。
15 芯片上基因cDNA是从什么组织中取得的?
　　芯片上基因cDNA来源于美国I.M.A.G.E.项目，是从人的各种组织中分离确定的，并且每个基因　　cDNA具有明确功能定义的，与其它基因不相重复的。