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细胞基因组DNA制备

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实验原理:在去污剂SDS及EDTA存在下,通过蛋白酶K消化细胞蛋白质,RNA酶消化RNA获得细胞基因组DNA。本方法获得的DNA可用于Southern杂交及构建文库
一、实验材料:
1.细胞消化缓冲液:
100mM NaCL
10mM Tris·CL (PH=8.0)
25mM EDTA (PH=8.0)
0.5% SDS (生工)
0.1mg/ml蛋白酶K(储存液20mg/ml,在-20℃储存,临用前稀释添加) (Boehringer)
2.PBS
3.TE(PH=8.0)
4.酚:氯仿(1:1)
5.3M乙酸钠
6.100%乙醇和70%乙醇
7.1mg/ml胰RNA酶 (国产)
二、实验方法:
1.贴壁细胞经EDTA 消化成细胞悬液,1000rpm×5min离心收集细胞。
2.5ml冰预冷的PBS 重悬细胞沉淀,1000rpm×5min离心,重复两次最后去上清,混匀管底使细胞成悬液,加入细胞消化缓冲液(细胞数〈3×107,细胞消化缓冲液300ul;大量细胞时如108,细胞消化缓冲液1ml,应充分分散混匀)。
3.50℃振荡12-18小时。
4.等体积酚 :氯仿(1 : 1)抽提消化液,10000rpm×5min离心。
5.用大口径移液器将上清液转移至新管,加入1/10体积乙酸钠和2倍体积无水乙醇,10000rpm×5min离心沉淀DNA。
6.70%乙醇洗沉淀然后晾干(不可完全干燥,否则极难溶解)。
7.50-150ul TE(含1mg/ml胰RNA酶)溶解沉淀。
三.实验结果鉴定标准:
1.测OD值,260nm与280nm的比值应大于1.75,DNA浓度应大于0.14ug/ul。
2.通过EcoR I酶做部分消化,电泳观察DNA长度。
四.参考文献:
1.Ausubel F. M., Brent R., et al, 1995, Preparation and Analysis of DNA.
In “Current Protocol in Molecular Biology”, 2, 21-23.
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