HLA系统中的连锁不平衡
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HLA
系统中的连锁不平衡
连锁不平衡(1inkagedisequilibrium)是指在某一群体中,不同座位上某两个等位基因出现在同一条单体型上的频率与预期值之间有明显的差异。连锁不平衡的程度可以由连锁不平衡参数厶来表示。HLA系统中经典的工类区域座位和Ⅱ类区域座位均存在连锁不平衡。
如在白人中,HLA-A1基因频率为0.275,HLA-B8基因频率为0.157。A1与B8在同一条单体型上的预期频率为0.043(0.275X0.157),但在群体中A1―B8在同一条单体型上实际频率为0.098,连锁不平衡参数厶为0.098―0.043=0.055。Ⅱ类区域中DQ亚区与DR亚区之间存在强连锁不平衡,特别是DRBl、DQA2、DQ月J三座位某些等位基因之间往往呈现很强的连锁不平衡,可能反映它们之间缺少交换或这些特定等位基因的组合经历了特殊条件下的自然选择。
连锁不平衡的存在,造成不同人群中,尤其在隔离群体中,出现I类座位和Ⅱ类座位不同等位基因的非随机组合,由此构成的单体型被称为祖先单体型(ancestral haplotype)。这些祖先单体型在一定程度上可作为该群体的遗传标志。
连锁不平衡现象在一定程度上限制了群体中HLA单体型的多样性,这给器官移植寻找HLA相容供体提供了机会,但却给HLA与疾病关联研究中寻找原发性关联成分增添一定麻烦,因为所发现的某个HLA易感基因,很可能仅是与该原发性易感基因处于连锁不平衡中,属于次级关联成分。