应用共用基序寻找和获取带有T表位特异性抗原
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应用共用基序寻找和获取带有 T 表位的特异性抗原
对特定抗原或病原体的易感性如果受MHC等位基因的约束而呈现出一种称为疾病与MHC关联格局，可以通过该MHC等位基因分子抗原结合槽的共用基序，寻找特异的致病性抗原表位。如果某一种I类分子接纳9肽时的共用基序，在锚着位p2和p9的氨基酸残基为脯氨酸(P)和亮氨酸(L)(注意：人和小鼠主要MHC等位基因分子的共用基序已经公布，可以查找)，则可以用电脑从该抗原分子一级结构中搜寻，然后合成一组9肽分子，特征为Nx-x-x-x-x-x-L。再用这些9肽去激发MHC背景相同的T细胞。T细胞一旦增殖，意味着带有某9肽的pMHC可被T细胞的TCR所识别，也即该pMHC复合物具有抗原提呈功能，或者说
该MHC分子结合的抗原肽带有特异性的T细胞表位。以此可找到并确认相应的抗原分子，或由此发展肽疫苗。
利用共用基序通过肽合成和功能测定确定抗原的功能性表位
A。从抗原一级序列中寻找符合特定MHC I等位基因分子共用基序xP-x-x-x-x-x-x-I。的5条9肽并人工合成，作为表位候选肽段(分别以五色圆圈表示)；B。测定可接纳该共用基序的MHC I类分子与候选肽段的亲和力及结合能力，选择高亲和力者(绿色)；C。以淋巴细胞克隆扩增实验对选中的肽段作功能性验证，确认其具有激活T细胞的能力。
