以蛋白分子为靶目标的噬菌体肽库模拟抗原的筛选
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以蛋白分子为靶目标的噬菌体肽库模拟抗原的筛选
(1)将单克隆抗体 用包被液CBS稀释,加入酶标板,一般抗体包被浓度为10ug/孔,包被体积为100ul/孔,稍加晃动使孔表面变湿,置于4℃下包被过夜(或37℃慢摇孵育2h)。第二天倾去板中包被液,每孔加入200ul/孔洗板液(PBST05),静置5rain,甩去洗板液,于无菌干净的滤纸上拍打,以尽量除去剩余的液体,重复洗5次,以下的洗板操作都与此相同。加入封阻液(PBSTOS-1%BSA)200ul,于37℃慢摇孵育1 h。倾去封阻液,尽量出去剩余液体,加入洗板液(PBST05),洗板5次。
(2)用封阻液(PBST05-1%BSA)稀释噬菌体肽库至1010 TU/ml(~2X1011 病毒颗粒/mi),同时加入无关鼠单克隆抗体(稀释效价为1:100),混合后加入抗体孔中100ul/ml,37℃慢摇孵育1h;加入洗板液(PBST05),洗板5次;再加入洗板液(PBST5),洗板5次;把板倒扣在吸水纸上拍几下,使孔中没有液体;加入100ul/孔洗脱液,室温慢摇孵育洗脱不超过10min(这步可采用竞争洗脱法,即加入一定浓度的天然抗原,37℃,隆摇孵育60min进行竞争洗脱,将特异性结合在抗上的噬菌体肽竞争下来)。取一条新的酶标板,预先加入
15ul、孔中和液,将洗脱液100//l加入到此酶标板中,使其pH值变为中性(洗脱液颜色由淡黄色转为玫瑰红色)。
(3)将115ul的噬菌体溶液转入事先已放人大肠杆菌K91Kan感受态细胞的15ml试管中,室温慢摇感染10-30min;将上述感染细胞转入2ml含LB-0.2Tet试管中,37℃慢速震荡(~100r/min)培养30-60min。取6/1l上述培养液作噬菌体效价的测定,并在其余的感染细胞培养液中加Tet母液至20ug/ml,37℃震荡(~230r/min)培养过夜(这步也可以用固相扩增的方法,即将感染的细胞培养液涂在3个大的LB-Tet40-Kanl00平板上,于37℃培养过夜)。取6ul上述培养液作10X倍比稀释后,分别以100ul/块平板涂在LB-Tet40-Kanl00平板上,每个稀释度要有重复的平板,倒置平板于37℃培养过夜,计数噬菌体菌落数,计算回收噬菌体的效价和噬菌体的获得率。测定并纪录每次筛选噬菌体的输入量和输出量,通过计算每一轮的噬菌体获得率来检验噬菌体的富集情况。次日按噬菌体扩增和纯化的方法回收和纯化筛选得到的噬菌体,并测定纯化噬菌体的效价,作为下一轮筛选的噬菌体溶液【用固相扩增的方法,则将培养皿上的菌落用LB液体培养基冲洗下来转入离心管中,37℃震荡(270r/min)培养1h后,回收并纯化释放至液体中的噬菌体,其他步骤同上】。一般对同一靶分子筛选3-4次,在第二次筛选时可适当降低包被抗体的浓度,增加筛选压力。
(4)将最后一次筛选洗脱下来的噬菌体中和后,取一部分噬菌体感染大肠杆菌细胞,用固相扩增的方法,即将感染的细胞培养液涂在多个大的LB-Tet40-Kanl00平板上,于37℃培养过夜。这样可得到噬菌体的单克隆化,便于进一步鉴定,同时也可测定噬菌体效价。其他噬菌体不扩增于一30℃保存备用。