dxy_l1y15rd2
请问怎么从下载的一个microRNA的靶基因数据中筛选参与肿瘤转移的基因呢?
dxyc42u
首先通过已有文献报道,进行整理大量可信的“靶基因”(尽量选择影响因子高的文献、样本量大)。经NCBI查找基因编码的NM号(注意物种)。根据您自己的科研目的,选择基因序列中的某一段进行研究。之后进入Snpper网站进一度查找到该基因相对应的NM号,进一步可查到该靶基因的研究序列中的多个点突变位点,可获得该位点的RS号,可在Hapmap网站得到进一度的验证,可查看该位点的突变频率。这样就可以筛到相对可靠的位点啦!
汤姆卜丽波
你可以在肿瘤转移相关数据库中获取基因矩阵,然后和你的基因取交集做韦恩图
loveliufudan
从下载的microRNA靶基因数据中筛选参与肿瘤转移的基因,可以采用以下方法:
1.利用肿瘤转移相关的基因数据库,如OncoTarget、OncoLnc、Cancer Gene Census等,查询靶基因是否为肿瘤转移相关基因。
2.阅读相关文献,查询靶基因在肿瘤转移过程中的作用及其机制。
3.使用肿瘤转移相关的基因表达资源,如TCGA、GEO等,查询靶基因在肿瘤组织中的表达情况。
4.使用肿瘤转移相关的基因网络数据库,如STRING、KEGG、Reactome等,查询靶基因与肿瘤转移相关基因之间的关系。
这些方法都可以帮助你更好的筛选参与肿瘤转移的基因。