RT-PCR新手上路急盼园主等前辈帮助!!!!
丁香园论坛
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我是一名新手,最近准备做一项RT-PCR检测小鼠脾组织含某种病毒的工作,刚接
触分子生物学,在丁香园上看了诸多帖子,感觉是受益非多。但由于没有实践,
很多东西仅停留在感性认识,有些还不怎么懂,希望得到前辈的帮助。
1.脾组织的磨碎:我询问并参观了学校的有关老师的做法:在用Triol提的时候
,是把脾组织称取50mg放入1.5ml离心管内,加入提取液后,然后用眼科剪剪碎
,之后用手拿离心管按在磁力涡旋混匀器打悬,由于剪刀一下很难剪碎,所以反
复多次用剪刀剪。感觉很费时[约2-4小时],而且由于样本多时,剪刀很容易混
合交叉污染。询问是否可用研磨器,答之倒来倒去怕影响定量。我的实验因为是
药理实验,可能动物标本比较多,如果这样处理,实在是很费时,不知前辈们有
什么好办法?看了大家的经验,说可以用匀浆的。不知是什么匀浆器。我们这里
条件简陋,只有研药用的研钵以及手动的玻璃组织研磨器,不知可不可以用。组
织研磨器研磨组织时一些组织会磨不碎,是否可用,如果这些可以用,一般用时
先期应该怎样处理。
2.RT-PCR听说做内参才算可靠。听说分竞争性内参和菲竞争性内参,它们的优缺
点是什么?适合怎样的场合。选择肌动蛋白之类的内参是否根据模板的不同,每
个人选择的和设计的序列也不同?。为什么内参加入后能起到半定量的作用?,
是否内参应与模板一段序列有相同?。
内参是加在同一管中的吗?那酶与其他反应物的量与没加内参时是否要加倍,应
该怎样变化的?
我的实验是用病毒攻击小鼠,然后用药,最后用RT-PCR检测各组鼠脾的病毒,相
互比较药物抑制病毒的效果,如果每组抽着做2-3只鼠脾PCR,检测出来的数据根
本没法说明问题,如果用PCR定量检测每只动物的脾病毒量,半定量的RT-PCR能
否做到这一点吗?不知有没有经济而可靠的方法?
3、PCR产物跑胶后的图没有相关的专业分析软件,不知有没有方便的软件可以计
算灰度之类的,到哪可下载一个?
4、由于初次接触RT-PCR,很多东西不知具体应该怎么做。不知前辈有没有自己
成熟工作成果,能结合一个具体的研究实例,从如何引物设计,到内参的设计与
加入,到最后PCR产物凝胶图象的分析等有理论有实践的文章,如果有的话能寄
给我一份,将使我终身受益,不啻是黑暗中的引路人,不胜感激!!!我的邮箱
是kjyxu@sina.com.cn
触分子生物学,在丁香园上看了诸多帖子,感觉是受益非多。但由于没有实践,
很多东西仅停留在感性认识,有些还不怎么懂,希望得到前辈的帮助。
1.脾组织的磨碎:我询问并参观了学校的有关老师的做法:在用Triol提的时候
,是把脾组织称取50mg放入1.5ml离心管内,加入提取液后,然后用眼科剪剪碎
,之后用手拿离心管按在磁力涡旋混匀器打悬,由于剪刀一下很难剪碎,所以反
复多次用剪刀剪。感觉很费时[约2-4小时],而且由于样本多时,剪刀很容易混
合交叉污染。询问是否可用研磨器,答之倒来倒去怕影响定量。我的实验因为是
药理实验,可能动物标本比较多,如果这样处理,实在是很费时,不知前辈们有
什么好办法?看了大家的经验,说可以用匀浆的。不知是什么匀浆器。我们这里
条件简陋,只有研药用的研钵以及手动的玻璃组织研磨器,不知可不可以用。组
织研磨器研磨组织时一些组织会磨不碎,是否可用,如果这些可以用,一般用时
先期应该怎样处理。
2.RT-PCR听说做内参才算可靠。听说分竞争性内参和菲竞争性内参,它们的优缺
点是什么?适合怎样的场合。选择肌动蛋白之类的内参是否根据模板的不同,每
个人选择的和设计的序列也不同?。为什么内参加入后能起到半定量的作用?,
是否内参应与模板一段序列有相同?。
内参是加在同一管中的吗?那酶与其他反应物的量与没加内参时是否要加倍,应
该怎样变化的?
我的实验是用病毒攻击小鼠,然后用药,最后用RT-PCR检测各组鼠脾的病毒,相
互比较药物抑制病毒的效果,如果每组抽着做2-3只鼠脾PCR,检测出来的数据根
本没法说明问题,如果用PCR定量检测每只动物的脾病毒量,半定量的RT-PCR能
否做到这一点吗?不知有没有经济而可靠的方法?
3、PCR产物跑胶后的图没有相关的专业分析软件,不知有没有方便的软件可以计
算灰度之类的,到哪可下载一个?
4、由于初次接触RT-PCR,很多东西不知具体应该怎么做。不知前辈有没有自己
成熟工作成果,能结合一个具体的研究实例,从如何引物设计,到内参的设计与
加入,到最后PCR产物凝胶图象的分析等有理论有实践的文章,如果有的话能寄
给我一份,将使我终身受益,不啻是黑暗中的引路人,不胜感激!!!我的邮箱
是kjyxu@sina.com.cn