急问关于RT-PCR引物设计问题
丁香园论坛
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我想作RT-PCR,扩一个长度为1352kb的基因,用pcDNA3.1作载体表达。
我要得到cdna全长,不知道应该怎么设计引物和酶切位点。
mrna序列如下
CAGGCTCTGTGTTGGTTGGAGCGAGCATGTGGGTCTGCAGTACCCTGTGGCGGGTGCGAACCCCGCCCGG
CAGTGGCGGGGGCCTGCTCCCAGCTTCTGGCTGTCACGGACCTGCCGCCTCCTCCTACTCCGCATCCGCC
GAGCCTGCCCGGGTCCGCGGCGTTGTCTATGGGCACCACGGGGATCCAGCCAAGGTCGTCGAACTCAAGA
ACCTGGAGCTAGCTGCTGTGAGAGGATCAGATGTCCGTGTGAAGATGCTGGCGGCCCCTATCAATCCATC
TGACATAAATATGATCCAAGGAAACTACGGACTCCTTCCTGAACTGCCTGCTGTTGGAGGGAACGAAGGT
GTTGCACAGGTGGTAGCGGTGGGCAGCAATGTGACCGGGCTGAAGCCAGGAGACTGGGTGATTCCAGCAA
ATGCTGGTTTAGGAACCTGGCGGACCGAGGCTGTGTTCAGCGAGGAAGCACTGATCCAAGTTCCGAGTGA
CATCCCTCTTCAGAGCGCTGCCACCCTGGGTGTCAATCCCTGCACAGCCTACAGGATGTTGATGGACTTC
GAGCAACTGCAGCCAGGGGATTCTGTCATCCAGAATGCATCCAACAGCGGAGTGGGGCAAGCGGTCATCC
AGATCGCCGCAGCCCTGGGCCTAAGAACCATCAATGTGGTCCGAGACAGACCTGATATCCAGAAGCTGAG
TGACAGACTGAAGAGTCTGGGGGCTGAGCATGTCATCACAGAAGAGGAGCTAAGAAGGCCCGAAATGAAA
AACTTCTTTAAGGACATGCCCCAGCCACGGCTTGCTCTCAACTGTGTTGGTGGGAAAAGCTCCACAGAGC
TGCTGCGCCAGTTAGCGCGTGGAGGAACCATGGTAACCTATGGGGGGATGGCCAAGCAGCCCGTCGTAGC
CTCTGTGAGCCTGCTCATTTTTAAGGATCTCAAACTTCGAGGCTTTTGGTTGTCCCAGTGGAAGAAGGAT
CACAGTCCAGACCAGTTCAAGGAGCTGATCCTCACACTGTGCGATCTCATCCGCCGAGGCCAGCTCACAG
CCCCTGCCTGCTCCCAGGTCCCGCTGCAGGACTACCAGTCTGCCTTGGAAGCCTCCATGAAGCCCTTCAT
ATCTTCAAAGCAGATTCTCACCATGTGATCATCCCAAAAGAGCTGGAGTGACATGGGAGGGGAGGCGGAT
CTGAGGGGCTGGGTGCAGGCCCCTCAGTTGGGGCTCCCACCTTCCCCAGACTACTGTTCTCCTCACTGCC
TCTTCCTATTAGGAGGATGGTGAAGCCAGCCACGGTTTTCCCCAGGGCCAGCCTTAAGGTATCTAATAAA
GTCTGAACTCTCCCTTCCAAAA
pcDNA3.1图谱如下
我要得到cdna全长,不知道应该怎么设计引物和酶切位点。
mrna序列如下
CAGGCTCTGTGTTGGTTGGAGCGAGCATGTGGGTCTGCAGTACCCTGTGGCGGGTGCGAACCCCGCCCGG
CAGTGGCGGGGGCCTGCTCCCAGCTTCTGGCTGTCACGGACCTGCCGCCTCCTCCTACTCCGCATCCGCC
GAGCCTGCCCGGGTCCGCGGCGTTGTCTATGGGCACCACGGGGATCCAGCCAAGGTCGTCGAACTCAAGA
ACCTGGAGCTAGCTGCTGTGAGAGGATCAGATGTCCGTGTGAAGATGCTGGCGGCCCCTATCAATCCATC
TGACATAAATATGATCCAAGGAAACTACGGACTCCTTCCTGAACTGCCTGCTGTTGGAGGGAACGAAGGT
GTTGCACAGGTGGTAGCGGTGGGCAGCAATGTGACCGGGCTGAAGCCAGGAGACTGGGTGATTCCAGCAA
ATGCTGGTTTAGGAACCTGGCGGACCGAGGCTGTGTTCAGCGAGGAAGCACTGATCCAAGTTCCGAGTGA
CATCCCTCTTCAGAGCGCTGCCACCCTGGGTGTCAATCCCTGCACAGCCTACAGGATGTTGATGGACTTC
GAGCAACTGCAGCCAGGGGATTCTGTCATCCAGAATGCATCCAACAGCGGAGTGGGGCAAGCGGTCATCC
AGATCGCCGCAGCCCTGGGCCTAAGAACCATCAATGTGGTCCGAGACAGACCTGATATCCAGAAGCTGAG
TGACAGACTGAAGAGTCTGGGGGCTGAGCATGTCATCACAGAAGAGGAGCTAAGAAGGCCCGAAATGAAA
AACTTCTTTAAGGACATGCCCCAGCCACGGCTTGCTCTCAACTGTGTTGGTGGGAAAAGCTCCACAGAGC
TGCTGCGCCAGTTAGCGCGTGGAGGAACCATGGTAACCTATGGGGGGATGGCCAAGCAGCCCGTCGTAGC
CTCTGTGAGCCTGCTCATTTTTAAGGATCTCAAACTTCGAGGCTTTTGGTTGTCCCAGTGGAAGAAGGAT
CACAGTCCAGACCAGTTCAAGGAGCTGATCCTCACACTGTGCGATCTCATCCGCCGAGGCCAGCTCACAG
CCCCTGCCTGCTCCCAGGTCCCGCTGCAGGACTACCAGTCTGCCTTGGAAGCCTCCATGAAGCCCTTCAT
ATCTTCAAAGCAGATTCTCACCATGTGATCATCCCAAAAGAGCTGGAGTGACATGGGAGGGGAGGCGGAT
CTGAGGGGCTGGGTGCAGGCCCCTCAGTTGGGGCTCCCACCTTCCCCAGACTACTGTTCTCCTCACTGCC
TCTTCCTATTAGGAGGATGGTGAAGCCAGCCACGGTTTTCCCCAGGGCCAGCCTTAAGGTATCTAATAAA
GTCTGAACTCTCCCTTCCAAAA
pcDNA3.1图谱如下