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【原创】OMEGA质粒提取试剂盒说明书: 给刚进实验室,又需要做质粒提取的XDJM

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40142

自己的实验刚刚开始,又涉及到质粒的提取。翻译了OMEGA 的大/小规模质粒提取试剂盒的说明书(D6922-01和D6942-01)。希望能给和我一样的新手一点帮助,同时请大家指正多给建议,特别是自己的心得啊。全是自己打的,帮顶让大家都能下啊:)

E.Z.N.A Plasmid Miniprep Protocol 质粒小规模提取试剂盒

Product Number D6942 and D6943,D6944

注意:
1. 使用之前,把试剂盒中的一小管RNA酶加入溶液Ⅰ. 4℃保存

2. 加60ml 100%乙醇到DNA Wash Buffer Concentrate中. 室温保存

除试剂盒外还需准备:可达到10000×g的离心机

无核酸酶的离心管

无菌去离子水或TE缓冲液

纯乙醇

操作规程:(提取过程在室温下进行):

1. 在10-20ml试管中,将携带有所需质粒的E.coli接种到5ml LB培养基LB(含氨苄青霉素50μg/ml),37cº振荡培养12-16h。需特别指出的是:endA阴性的E.coli菌株用于常规质粒提取,如DH5α和JM109.

2. 取1.5~5ml菌液室温10000×g离心1mi

3. 去上清,加250µl溶液Ⅰ(含RNase A),涡漩振荡器震荡至菌体完全悬浮。

4. 加入250µl溶液Ⅱ,温和颠倒离心管4~6次,获得澄清的裂解液。最好室温孵育2min,剧烈混合会使剪切染色体DNA,降低质粒纯度。(储存溶液Ⅱ应拧紧瓶盖)

5. 加350µl溶液Ⅲ,温和颠倒数次混合,至出现白色絮状沉淀,室温10000×g离心10min.

6. 特别小心吸取上清,移至洁净的装配好容积2ml离心管的吸收柱中。要保证没有吸入沉淀和细胞碎片。室温10000×g离心1min,至裂解物完全通过吸收柱

7. 弃滤过液,加500µl Buffer HB,10000×g离心1min,清洗吸收柱,除去残余蛋白质保证DNA的纯度。

如果接下来的步骤对质粒纯度要求不高,如酶消化法等其它筛选方法,此步可省略

8. 弃滤过液,再用100%乙醇稀释的750µl Wash Buffer清洗吸收柱,10000×g离心1min注意:Wash Buffer浓缩液用前必须用纯乙醇稀释,方法见标签如果经过冷冻,用前必须恢复室温。

9. 此步可选:再加750µl Wash Buffer清洗吸收柱

10.必须将吸收柱10000×g离心1min确保乙醇被去除,乙醇会影响下面的步骤。

11.将吸收柱放入干净1.5ml离心管,加50-100µl(取决于需要的终浓度)无菌去离子水或TE缓冲液在滤膜上,10000×g离心5min,一次可洗脱75-80%附着DNA(可进行再洗脱,但会降低DNA浓度)。

12. 检测:

方法A:分别在260nm和280nm波长下测定20-50倍稀释液的吸光度
DNA浓度=260nm吸光度×50×稀释因子μg/ml
高质粒拷贝数能达到5ml培养液得到25μg DNA,如果260nm吸光度/280nm吸光度大于1.8,说明核酸大于90%。
方法B:和预知浓度DNA样品(Marker)一起做琼脂糖凝胶/嗅乙啶电泳,对比结果
   (通常情况得到的DNA是单体超螺旋,也有少量多联体)

E.Z.N.A. Plasmid Maxi Kit (D6922-01)质粒大规模提取试剂盒

注意:
1. 使用之前,把试剂盒中的一小管RNA酶加入溶液Ⅰ. 4℃保存

2. 加84ml 100%乙醇到DNA Wash Buffer Concentrate中. 室温保存

除试剂盒外还需准备:配有浮桶式转头(吊桶式转头)的离心机
可达到12000×g的高速离心机
50ml无菌离心管
高速离心管
无菌去离子水或TE缓冲液
纯乙醇

操作规程:(提取过程在室温下进行)
1. 将带有目的质粒的大肠杆菌接种到200-500ml LB(含氨苄青霉素50μg/ml),1-4升培养瓶中37℃震荡培养过夜(12-16h)
需特别指出的是:endA阴性的E.coli菌株用于常规质粒提取,如DH5α和JM109.
2. 取500ml菌液装入适当管子(推荐用250ml离心瓶)中,室温下3500-5000×g离心10min
3. 小心去上清,用洁净纸巾吸干管壁残留液体。加7.0ml溶液Ⅰ,吹打数次,用旋涡振荡仪充分悬浮沉淀
4. 移入50ml至少可承受12000×g的离心管,加7.0ml溶液Ⅱ,轻轻来回翻转混合7-10次,至澄清裂解液
注意:必须室温下孵育5-10min
   避免大力混合,以减少对染色体DNA的机械力切割,提高质粒纯度
5. 加10ml溶液Ⅲ,温和倒转数次,至有絮状沉淀形成
室温孵育5min并不时混合
室温离心10min得到致密的基因组DNA和碎屑团块
6. 特别小心地吸取上清,加到装配好容积50ml离心管的大型吸收柱,上盖,装入吊桶式转头,室温3000-4000×g离心5min
注意:确保没有搅动沉淀以保证质粒回收率
   有必要牺牲2-4ml溶菌产物
   单次最多加25ml溶菌产物,如果较多,分2次加入
   可用此管直接重复步骤6

注意:接下来的步骤都会用到浮桶式转头(吊桶式转头)离心机(用固定角转头会使提供的50ml离心管变形或破裂)
7. 加50ml HB缓冲液到吸收柱,上盖,室温3000-4000×g离心5min(此步为确保除尽剩余蛋白,同时使后面的操作得到的是高纯度DNA)
8. 加10ml用乙醇稀释的DNA Wash Buffer,上盖,室温3000-4000×g离心5min,弃掉滤过液
注意:Wash Buffer浓缩液用前必须用纯乙醇稀释,方法见标签
  如果经过冷冻,用前必须恢复室温
9. 此步可选:重复步骤8
10. 加10ml纯乙醇,室温3000-4000×g离心5min,弃掉滤过液
11. 将空管上盖3000-4000×g离心10min甩干(用移液器去掉甩到离心管中的乙醇)
注意:此步必做!残留的乙醇会影响接下来的步骤
12. 洗脱DNA之前可用以下方法进行干燥,以得到更干燥的吸收柱(如果没有真空箱/室,可直接执行步骤13)
方法A:取出吸收柱,将吸收柱在真室箱/室中15min,执行步骤13
方法B:取出吸收柱,在65℃真空干燥箱或恒温箱中干燥10-15min,执行步骤13
13. 将吸收柱放入干净50ml离心管,加1-2ml(取决于需要的终浓度)无菌去离子水或TE缓冲液在滤膜上,3500×g离心5min,一次可洗脱70%附着DNA(可进行再洗脱,但会降低DNA浓度)
建议:洗脱前,如果将吸收柱放入70℃热水中浸泡2min,会明显提高回收率同时得到高浓度DNA
注意:清除在吸收柱内部O形圈边缘的DNA Wash Buffer残留非常重要
如果在洗脱前没有真空干燥吸收柱,最后需对质粒DNA进行净化,方法如下:
加氯化钠到洗脱液至终浓度200mM,再加0.8体积的异丙醇,旋涡振荡混合,10000×g离心10min,用70%乙醇清洗沉淀,10000×g离心10min,轻轻倒出上清,短暂风干,用200-500μl无菌去离子水或TE缓冲液再悬浮DNA
14. 检测:
方法A:分别在260nm和280nm波长下测定20-50倍稀释液的吸光度
DNA浓度=260nm吸光度×50×稀释因子μg/ml
高质粒拷贝数能达到500ml培养液得到1mg DNA,如果260nm吸光度/280nm吸光度大于1.8,说明核酸大于90%。
方法B:和预知浓度DNA样品(Marker)一起做琼脂糖凝胶/嗅乙啶电泳,对比结果
   (通常情况得到的DNA是单体超螺旋,也有少量多联体)

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