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荧光定量PCR仪浅谈之一-仪器性能比较

丁香园

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荧光定量PCR仪在国内市场推广从98年开始已经经历了6年,从开拓者PE(ABI)到ROCHE,再到后来鱼龙混杂,各种荧光定量PCR仪纷纷登陆我国市场,使得中国市场成为世界上最为繁荣的荧光定量PCR技术应用市场,笔者由于从一开始就从事该项技术再中国的推广,就亲身经历的几种仪器来谈谈他们的优缺点,抛砖引玉使大家在应用这项技术的过程中提供一定的帮助。

荧光定量PCR仪的鼻祖是PE7700(ABI公司推出)。而后从其进入我国市场的时间顺序上分别产生了PE5700、ROCHE的lightcycler、biorad的icycler、澳洲的ROTOR GENE3000等,还有就是在01、02年之后任何一台荧光PCR仪都在中国赚得盆满钵满之后许多荧光pcr仪纷纷进入中国,枫岭、MJ等等许许多多,不一而足。

每种仪器在市场推广过程中都会“制造”许多与其他产品不同得优势以获得相对得比较优势,但从笔者多年得使用经历和比较中得出一个结论,那就是无论厂商如何宣传,判断一台荧光PCR仪的好坏的依据不是PCR反应时间(它不是百米赛跑),不是PCR体系大小(它不是蔬菜)。

不是PCR仪器大小(它不是彩电),而是PCR扩增水平(非仅仅升降温速度)、荧光检测水平和荧光数据分析水平(软件)这三方面。这里笔者先谈谈PCR扩增水平。

PCR扩增水平是荧光pcr仪的基础,扩增水平的高低将直接影响整个仪器PCR过程的定量水平。荧光PCR仪与一般PCR仪对PCR扩增水平的要求并不一致。荧光PCR仪除了一般PCR仪对扩增的要求之外,更对不同管的PCR均一性有非常高的要求,管间差是衡量荧光定量PCR仪在扩增方面最主要的技术指标。

就以管间差而言,国内目前这些荧光定量PCR仪中,以PE(ABI)和ROCHE的仪器管间差最小。PE公司的仪器无一不是以PE9600为基础,而所有使用过9600的人都不会否认其在扩增方面卓越的品质,特别是在扩增的均一性方面使得PE出品的扩增仪的管间差都非常小,PE7700所达到的水平是其他仪器都很难达到的。

也正因为此,PE公司才能够在推出7700标准型之后,在中国推出5700的7700型简化版仪器(全球仅在中国市场销售)。即使5700与7700比较在软件、光路检测系统等等诸多方面十分简陋,5700在实际使用过程中仍能得到较好的结果。

可以说,如果没有PE公司在扩增水平上的超强优势,PE公司根本不会生产5700这种简化版垃圾仪器,即便如5700这样简陋的仪器,在当时国内市场中仍没有多少竞争对手。在大家无法承受7700高昂价格的无奈情况下,5700也不韪是一个较为折中的选择,这种局面一直维持到ROCHE的Lightcycler的出现才被打破。

ROCHE的Lightcycler为大家除了忍受PE公司的蛮横高价之外提供了第二种选择的机会。笔者认为ROCHE的Lightcycler是除7700之外唯一具有创造力和想象力的产品。ROCHE的Lightcycler原为德国宝灵曼公司自主研制开发的,后因宝灵曼整体被ROCHE兼并才成为ROCHE的品牌产品。

所以我们看到ROCHE拥有的PCR和Taqman专利而Lightcycler却与Taqman有很大的差别这样非常奇怪的现象。这只是因为PE最早向ROCHE购买了Taqman和PCR的专有使用权逼得宝灵曼只能另辟蹊径的想出空气加热和毛细管反应系统。

也正因为此,让我们通过ROCHE的Lightcycler真正领略了德国人在机械制造方面的创造力和想象力以及高超的机械制造水平。均匀的空气加热解决了半导体加热不一致的问题,毛细管体系用加大接触面积解决了空气作为热源其热效不高的问题。

一环扣一环,其技术涵养可见一斑。然而毕竟与我们常规PCR有着巨大的不同,使得我们在使用时无法与常规系统(离心管)进行比较。在常规PCR摸好的条件在ROCHE的Lightcycler上可能得重头来过。

并且最突出的问题是毛细管使用不方便和价格昂贵。

至于其他仪器,我们或多或少都可以看到其在某些方面对PE7700和ROCHE的Lightcycler的模仿。至于模仿水平的高低,我们以后再说。

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