师姐独家收藏的分子克隆小技巧
生物学霸
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看了标题点进来的,想必是想学得师姐一招半式,好在实验中大展拳脚。不会让大家失望的,今天就谈谈分子克隆的独家经验,可以回复目录查看以往师姐传授的经验。
务必做好对照
一定要做好对照,各种对照,只要你能想到。做的时候千万不要偷懒。比如构建质粒,我最后转化会至少分三个平板,一个涂实验组,一个涂连接过程不加酶的对照(用于估计酶的活性和转化的阳性率),一个涂不加质粒的感受态细胞(用于确定感受态本身没有被污染,或是抗生素没有失效)。
再比如 PCR 产物跑胶的话,一个泳道加产物,一个单独加模板,一个单独加引物,然后至少两个泳道加标准条带。不要怕浪费钱浪费试剂,做不出结果还不知道 troubleshooting 该怎么做而去盲目重复才是最大的浪费,包括时间包括试剂。
同时进行多个实验
有些人一天只能做一个实验,效率真是低得可以。完全可以并行多个实验,比如在等转化的时候顺手配个培养基,跑胶过程中去划个平板,灭菌过程中去看文献等等,整体来看节约时间。
如果你还不不清楚怎么错开做实验,记住这点:多个实验同时进行的时候,其中一个是对时间要求严格,比如转化,另外一两个可以相对简单且不易出错的,比如配培养基。
做好标记
做实验前,先在实验记录本上写好样品全称和对应编号(阿拉伯数字或者字母都行,要简单)。实验过程中需要标记的无数个中间产物都直接用简单编号标记,这样不容易弄混。切记有些数字容易搞错,比如 1 和 7 ,8 和 B 等。
另外,标记日期时请固定用自己习惯的用法。yy/mm/dd 也好, mm/dd/yy 也好, dd/mm/yy 也好,选一个就好,固定下来。
当心实验材料
不同实验室的 LB 配方不一样,氯化钠可能是 5 g/L 可能是 10 g/L。同样是胰蛋白胨,用的不同厂家的,实验结果也会不一样。所以, 重复他人实验请谨慎。做实验最好保持原材料同一厂家,不要随意更换品牌。
此外,LB 培养基每一批的差异非常大,所以最好用大瓶统一配一批,保证自己几个重复实验用的是同一批的培养基。不然的话,数据差异很大。
转化效率
我试过热击转化和电转,电转效率简直逆天。没有条件的话,至少不要用 CaCl2 法了,改用 KCM 。KCM 比 CaCl2 转化率高了一个量级,操作复杂度基本一样。
可以存一些灭菌后的无抗琼脂 LB 固体,需要的时候微波炉热五分钟立马可以加抗生素倒平板。