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诊断埃博拉——塞拉利昂诊断实验室中的一天(上)

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在这两篇博文中的第二篇中,伊恩·古德费罗教授在Wellcome Trust博客上描述了埃博拉诊断实验室的平均一天,以及该团队在建立实验室时面临的挑战。

在塞拉利昂马克尼的头两周,我们的重点是尽快让埃博拉诊断实验室投入运作。该国这一地区的诊断能力确实不足,实验室设施需要在治疗中心开业前投入使用。

由于没有现有的诊断设施,所有样本都被驱动(或有时在联合国直升机上飞行)到位于博城的疾病控制中心(CDC)实验室。他们很棒,但尽管他们有一个非常快的周转时间来测试样品,物流的实际得到的样品,他们意味着这一进程大大放缓。在这个领域建立一个诊断设备是加速诊断的关键。

在我们所面临的条件下开设分子诊断实验室并非易事。有很多人在等待设备的运送,用手装载工具包,然后在营地周围转移箱子。

我的一个永久记忆是,必须要求整个团队用手在建筑工地上移动一个巨大帐篷的设备,因为临床工作人员需要帐篷来存放他们的个人防护设备(PPE)。

由于高温、潮湿和设备的巨大体积,我们不得不穿越一个现场建筑,这是一个真正的挑战。我没有真正考虑到的是,前两天球队的上半场已经把所有相同的箱子都卸到了第一个帐篷里。

不用说,当我们不得不重新安置他们时,他们并没有那么激动,但是经过一点讨论,球队做了一个出色的工作,所有的装备都被搬走了。几天后(水泡愈合后),这种相当超现实的情况成为我们的娱乐来源。

埃博拉治疗中心换班

当诊断实验室开放时,rota被设置成错开实验室的人数,以确保我们能够覆盖早上6点到晚上10点的开放时间。团队成员将在早上6点、8点、11点和2点开始轮班,晚班将一直待到所有工作完成。典型的轮班持续了大约8小时。

如果你在早班上班,平均一天会是这样的:

早上5:30

醒来,勇敢地洗个冷水澡。试着找点早餐吃的(招待所直到早上7点才供应早餐)。别忘了服用抗疟疾药,测体温(36.3摄氏度)。

早上5:45

等一下,希望司机记得带你去治疗中心。(物流和运输通常很好,但有时我们不得不等待运输。)

早上6:00

到达埃博拉治疗中心(ETC)。(在大门外面,三个相貌冷淡的国家ETC工作人员向我们打招呼。)

用漂白剂洗手,测量体温并回答问题以检查健康状况。(“你有瘀伤吗?“你睡得好吗?”?“等)。

在进入ETC前喷上漂白剂的靴子。穿过更衣室、唐·斯库布斯和惠灵顿靴子(我经常花10分钟,但通常都没找到两双合适的!)为了进入实验室的“绿色地带”。

(早晨的温度与典型的英国夏季相似,但比当地工作人员习惯的要冷得多。)。他们会找到巧妙的保暖方法,包括蜷缩在敞开的工业干衣机门前!)

早上6:10

到达实验室并解锁,更换鞋垫,快速查看实验室周围的情况,确保电源仍然打开,没有任何东西泄漏。

穿上长袍,戴上手套和护目镜。是时候补充漂白剂了——浸泡桶和隔离器的用量为10000 ppm,其他的用量为5000 ppm。拖地,擦板凳和前一天的空桶。

检查用于处理埃博拉阳性样本的隔离器,将其清理干净,并为前一天做好准备。检查实验室的所有库存物品-我们有足够的各种试剂的等份吗?大帐篷里的1.5毫升管子又在哪里?我们为司机准备了足够的EDTA血管吗?

(有一件事我不会错过,那就是氯气的强烈气味,我们在实验室使用的浓度比埃博拉治疗中心其他地方使用的浓度要高,而且在一个封闭的环境中,氯气烟雾变得相当强烈。甚至连临床工作人员都说,实验室外的氯味很浓。)

早上8:00

第二班到了。讨论前一天的结果-有多少积极的方面?出什么事了吗?所有的试剂都正常吗?

(高温和粉尘对设备和试剂有各种影响。缺乏可靠的互联网连接也意味着我们无法访问故障排除指南,因此严重依赖团队成员的经验和聪明才智来解决任何问题。)

早上8:30-11:00

一天中的第一组样本出现了。“少校”(可能不是他的真名)把他们赶了进来。

(梅杰是当地雇用的工作人员,他在埃博拉疫情期间做了英勇的工作。在马克尼实验室开放之前,他每天都要把样本送到大约5小时外的博城,这是当地人致力于控制疫情的一个例子。所有塞拉利昂工作人员都非常自豪能够以任何方式提供帮助。)

戴上额外的塑料围裙和面罩,以便处理和分类收到的样品。文件被带进实验室,用漂白剂擦掉。样品放入大隔离器(称为“BFG”)中打开。其中一个小组打开隔离器中的样品罐,检查袋子,没有接触里面的任何东西——有没有泄漏?里面有锋利的东西吗。

(我们被告知,在流行病的早期阶段,样本会出现在各种容器中,有时针头还在袋子里。谢天谢地,我们从未经历过这种情况。)

统计样本总数,并与收到的样本请求表单数进行比较。一个接一个地小心地从包装中取出每一个样品,并在隔离器内用漂白剂将其擦拭干净。对照样品申请表检查样品详情。

用一个唯一的实验室标识符标记样品,并排列成一批样品进行处理。样品被包裹在两个单独密封的袋子里,用漂白剂擦拭干净,10分钟后,它们可以移动到第二个隔离装置,在那里进行核酸提取。

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