细胞壁降解酶的一个新类别

碳水化合物活性酶主要存在于真菌中，包括白腐病、褐腐病和植物病原真菌。这些微生物降解植物细胞壁中含有木质素、半纤维素、纤维素、多糖和果胶的复杂基质。自1998年以来，CAZy数据库精心整理了五个碳水化合物活性酶家族的数据:糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)、多糖裂解酶(PL)、碳水化合物酯酶(CE)和碳水化合物结合模块(CBM)。

最近发现，一些成员的CBM和GH酶家族共同的作用模式，即裂解多糖单氧合酶(LPMO)，已促使CAZy的馆长对数据库进行重大更新。在他们发表在《生物燃料的生物技术》上的论文中，Levasseur和同事还指出，酶需要协同作用，以便分解植物细胞壁的相互连接的成分。考虑到这一点，他们创造了一种新的具有辅助活性的酶(AAs)来包围LPMOs，以及被认为协同作用的氧化还原木质素降解酶家族。

根据蛋白质序列的相似性，辅助酶被分为10科，并具有“辅助酶”的功能，以提高其他类酶降解植物细胞壁成分的途径。酶家族的生化和三维结构信息从文献中推断，每个家族至少有一个生物化学特征的创始成员。

对酶库进行了比较基因组分析，从可以在41个真菌基因组中识别的1576种AA酶。值得注意的是，在木霉中发现了少量的原子吸收酶。木霉在工业上被广泛用于生产碳水化合物转化酶。细菌降解酶的开发不如真菌，作者认为在反刍动物肠道菌群和土壤中发现的木质素降解菌将是今后的研究方向。