简介
原理
琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡的基本原理是凋亡出现时,细胞内源性的核酸内切酶被激活,将染色质 DNA 自核小体间降解,形成相差 180~200 bp的大小不等的寡核苷酸片段。
提取凋亡组织或细胞的 DNA,经琼脂糖凝胶电泳,分离不同长度的 DNA 片段,再经 EB 染色,紫外灯下观察,可见特征性的梯状条带(ladder)。
材料与仪器
器材:
① 500 mL 的锥形瓶
② 1.5 mL Eppendorf 管
③ 移液器吸头
④ 10 mL 吸管
⑤ 吸管橡皮球
⑥ 水浴箱
⑦ 微波炉
⑧ 离心机
⑨ 电泳仪
⑩ 电泳槽
⑪ 紫外灯
⑫ 微量移液器
⑬ HeLa 细胞(或别的细胞)。
试剂:
① 凋亡诱导剂(根据情况自定)
② 消化液(0.02% EDTA)
③ PBS
④ 裂解液
(NaCl(100 mmol/L,pH8.0),Tris-Cl(10 mmol/L),EDTA(25 mmol/L,pH8.0),SDS(5 g/L))
⑤ 蛋白酶 K(20 mg/mL)
⑥ RNA 酶(10 mg/mL)
⑦ 苯酚-氯仿-异戊醇(25:24:1)
⑧ 3 mol/L 乙酸钠(pH5.2)
⑨ 100% 乙醇
⑩ 70% 乙醇
⑪ TE 缓冲液
⑫ 电泳缓冲液(TAE)
⑬ 琼脂糖
⑭ EB(10 mg/mL)
⑮ 6 x 上样缓冲液
步骤
琼脂糖凝胶电泳法检测细胞凋亡的基本过程可分为如下几步:
A 将 5 x 106 个已诱导凋亡的细胞收集至 1.5 mL Eppendorf 管中,600 r/min 离心 5 min,弃上清液。
B 冷 PBS(4 ℃)重悬细胞,1000 r/min 离心,弃上清液。
C 加入 497.5 μL 裂解液、2.5 μL 蛋白酶 K,重悬细胞。56 ℃ 水浴 3 h(或 37 ℃ 过夜),期间轻摇几次。
D 加入等体积的苯酚-氯仿-异戊醇(500 μL),轻播 5 min,20000 r/min 离心 5 min,将水相移至一新 1.5 mL Eppendorf 管中。重复抽提一次。
E 加入 1/10 体积的乙酸钠(3 mol/L),2.5 倍体积的 100% 乙醇,上下颠倒、混匀,冰浴 10~15 min。20000 r/min 离心 10 min 沉淀DNA,弃上清。
F 70% 乙醇洗涤,晾干或真空抽干。
G 加入 TE 缓冲液 30~50 μL、RNA 酶 5 μL,37 ℃ 水浴 30~60 min[可重复步骤(4)~(6),以去除 RNA 酶]。
注意事项
1 苯酚有强腐蚀性,能引起烧伤。氯仿有致癌作用,对皮肤、眼睛、黏膜和呼吸道有刺激性。所以苯酚-氯仿-异戊醇相关的操作应戴手套、穿白大衣,在化学通风橱内操作。其废弃物应有专门的容器。
来源:丁香实验