材料与仪器
裂解缓冲液 磷酸盐缓冲液 含40%甘油的PBS 含 0.01g ml BSA的PBS 含 500 mmol L 甘氨酸 含0.1% Tween的PBS 含 1% BSA的PBST
偶联有蛋白 G 或蛋白 A 珠子的亲和层析柱设备 BSA-NHS玻片 离心机 荧光片扫描仪 孵育箱 超声破碎仪
步骤
一、抗体阵列的制备
要了解关于蛋白质阵列制备的详细介绍,可查阅本章介绍中的「10.8.2 制作蛋白质阵列」部分。要了解梗概,参见方案11。
1.将捕获抗体溶于含 40% 甘油(体积分数)的 PBS(pH7.5) 中,使其终浓度达到 0.5 mg/ml。缓冲液中不能含有亲核性成分(如 Tris)。
抗体常常会与 BSA 竞争性地与玻片发生连接反应。可用蛋白 G 或蛋白 A 的亲和层析柱将 BSA 除去。
2.为了使抗体连接到玻片上,将抗体阵列与玻片在室温条件下孵育 2 h。
3.在室温条件下,加人含 500 mmol/L 甘氨酸的 PBS(pH8.0) 终止反应,作用时间为 lh。
4.使用玻片之前,再用含 O.Olg/mlBSA 的 PBS 继续处理芯片 30~60 min,或者将玻片于 4°C 条件下浸泡在含 0.Olg/mlBSA 和 0.2 g/LNaN3 的 PBS 中保存。
在这样的条件下,抗体阵列可保持 1~2 月的稳定。
二、抗体阵列
5.哺乳动物细胞密度达到 1O7 个/ml 后,在冰上加入裂解液。
6.超声破碎细胞后,4°C、15000~2000g 离心 lOmin,去掉不溶物。
7.用 PBS 将抗体包被的玻片(由第④步得到)冲洗两遍。
8.将细胞裂解液和玻片放人保湿器中,于室温共同孵育 2~3 h。
CoverWellPC200 可以容纳 200/ixl 的细胞裂解液,而 PC500 可以容纳 550 沁裂解液。若阵列较小,可以只加人 10~30ul 裂解液,但要记得在玻片上用防水笔画上边界标记。
一般裂解液只需覆盖玻片就可以了。
9.依次用 PBST、PBS 冲洗玻片 3 次,每次 lmin。
10.在玻片上加上鸡尾酒混合液,室温孵育 lh。
11.依次用 PBST、PBS 冲洗玻片 2 次,每次 lmin。
12.200 g离心 30s, 以去掉残留的缓冲液。
13.用荧光片扫描仪观察芯片图像。
来源:丁香实验