生物信息学实验

原核生物全基因组组装测序已有了较为成熟的方法体系，但是在组装好的基因组注释上还没有较为快捷简便的方法。Prokka: rapid prokaryotic genome annotation，快速的原核基因组注释，是一个适用于原核生物基因组的快速高效的自动注释工具，以 FASTA 格式的预组装基因组 DNA 序列为输入文件，能够对原核基因组和宏基因组进行快速高效的功能注释，在基因组序列上识别和标记所

基因芯片（gene chips），又称为DNA芯片（DNA chips）、DNA阵列（DNA array）等，是指在固相支持物上原位合成（in situ synthesis）寡核苷酸或者直接将大量DNA探针以显微打印的方式有序地固化于支持物表面。然后与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号来实现对DNA等生物样品的快速、平行、高效的检测。它是微电子、计算机、分子生物学等多学科交叉融合的一门高新技术，

针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因，找出基因的位置和功能位点的位置，以及标记已知的序列模式等过程。内容来源：广东药学院实验指导手册。

核酸序列是了解生物体结构、功能、发育和进化的出发点。国际上权威的核酸序列数据库有三个，分别是美国生物技术信息中心（NCBI）的GenBank，欧洲分子生物学实验室的EMBL-Bank（简称EMBL），日本遗传研究所的DDBJ。内容来源：广东药学院实验指导手册。

数据库是生物信息学的主要内容，各种数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域；生物信息学软件的主要功能有：分析和处理实验数据和公共数据，加快研究进度，缩短科研时间等。内容来源：广东药学院实验指导手册。

通过比色法测定水杨酸的半衰期，水杨酸根与铁离子起反应，形成一种紫色络合物，根据紫色络合物的颜色进行比色得光密度，将光密度代入公式计算得半衰期。本实验目的是掌握药物血浆半衰期（t1/2）的测定方法及计算血浆半衰期（t1/2）

表达谱基因芯片可应用于：（1）疾病诊断；（2）新药开发；（3）环境保护。

用于基因芯片分析的血液样品的准备可用于：（1）基因表达分析；（2）分析血液中白细胞的基因表达情况。