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做出来的有差异表达的蛋白,又做了一批用WB的无差异?

相关实验:实质等同性(蛋白质组学)实验

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生物是垃圾

结果没有差异。。。本来我满心欢喜的,蛋白质组学的P值0.03左右,这种情况下我要不要wb验证,而且第一次没差异是不是要多做几次啊,我组学送样时候是每组三复孔的啊。。。

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2 个回答

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AIDD组学

有帮助

p 0.03,这个 值很大的了,假阳性率很高,一般至少都是p<0.05.蛋白质组学是一个非靶向的实验,并不是一个靶向实验,所以有假阳性的结果是很正常的,即使验证也是选取的P值较小的,且FC值变化较大的。

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麦克林托克

有帮助

你要看这个蛋白的unique peptide的差异是多少。

如果蛋白有多个variant,蛋白质组学数据搜库时,会把所有的肽段归为含有unique peptide那个蛋白,因为打到unique peptide的那个蛋白一定存在,但是其他的peptide也可能是属于另一个蛋白的,这就干扰了蛋白的真实定量,所以蛋白质组学结果一般都需要WB的再次验证

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