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QTL在染色体上的定位图

相关实验:染色体显带技术

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一定毕业毕业毕业

请教各位老师和学长学姐,我在一条染色体上定位到多个与表型相关的QTLs,请问如何利用Mapchart来做出这种QTL在染色体上的定位图呢?主要作图方法我会,但是我不知道这个外区间和内区间的那个数值是怎么确定的,没有看懂给的示例。

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3 个回答

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sswei

有帮助

按照图例,外区间在1.3一18.6,内区间在7.9一12.3。

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loveliufudan

有帮助

MapChart是一种有用的工具,可以将QTLs(数量性状位点)可视化在染色体上。在你提供的示例中,提到的外部和内部区间是指QTL的置信区间。外部区间是较宽的置信区间,通常是标准误差的1.5-2倍,而内部区间是较窄的区间,通常是1个标准误差。这些区间可以使用统计方法(如LOD分数、贝叶斯因子或置换检验)确定。示例中提供的值是任意的,并不反映任何实际的QTL分析结果。

要使用MapChart绘制QTLs,可以按照以下步骤操作:

创建一个包含QTL信息的文本文件,格式应符合MapChart指定的格式。每个QTL应单独列出,并应包括染色体、位置和置信区间。

打开MapChart并选择“新绘图”。

将“染色体”作为绘图类型。

选择QTL所在的染色体。

点击“添加”并选择在步骤1中创建的QTL文件。

选择QTL标记的颜色和样式,以及置信区间的颜色和样式。

根据需要自定义绘图(例如添加比例尺或更改字体大小)。

将绘图保存并导出为图像文件。

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土井挞克树

有帮助

先选定一个大区间,然后划分小区间进行定位。

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