loveliufudan
斑马鱼发育时空图谱有助于理解哪些胚胎发育过程中的模式形成及相关分子机理?
sswei
时空组相对应时间点的胚胎,进行单细胞测序,并利用SPOTlight整合scRNA-seq和Stereo-seq数据,绘制了斑马鱼胚胎的空间发育轨迹。最后,通过计算空间中不同时间点中配体-受体对的相对距离,发现在胚胎发育中具有潜在互作关系的配体-受体对,并确认了其在发育中具有的潜在调控功能。在10 μm的分辨率下,对不同时间点的斑马鱼胚胎进行了空间区域的划分,区分出不同组织边界。同时通过进一步的细化分群,在空间位置上区分出空间位置临近的不同细胞亚群和组织。