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丁香通

单基因泛癌分析TIMER和GEPIA数据库结果不一致

相关实验:整装培养细胞生物膜系统的标本制备及观察实验

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DDDgreat

RT,有意义的癌种类相差很大,怎么解释,或者下一步应该咋办啊

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5 个回答

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yanlai000

有帮助

不同数据库使用的测序数据来源不同,不一致很正常,建议用同一个数据库的结果,有条件自己qPCR验证,这样结果才可靠

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TovY0916

有帮助

差异大可以分析一下差异大的原因,可以找对应癌症的其他数据,单细胞或者表观,主要看能不能解释通

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Dr_劉医生

有帮助

生信分析就是这样,你复现已发文献的结果也是多个数据库一起,建议把其他这几个也同步检索和分析一下:

  1. Oncomine数据库(www.oncomine.org)
  2. UALCAN数据库(http://ualcan.path.uab.edu/)
  3. cBioportal数据库(https://www.cbioportal.org/)
  4. STRING数据库(https://string-db.org/)
  5. Venn数据库(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/)
  6. DAVID数据库(https://david.ncifcrf.gov/)
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灵枢天问

有帮助

再找几个数据库看看有没有趋势一致

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

使用同一数据库,不同数据库实验条件不一样,一定结果有差异

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