能将细菌经过不同处理后寻找蛋白胶差异带最终实现蛋白鉴定吗？

能将细菌经过不同处理后提取不同处理的菌体总蛋白，跑PAGE天然胶，寻找找差异带，最后对蛋白质胶条质谱鉴定。这种实验方案靠谱吗？能找到有意义的蛋白吗？一般给到的结果里会有多少候选蛋白？