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流式数据分析

相关实验:DNA和RNA的同步流式分析

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sunshineCSYE

请问有前辈可以分享一下流式细胞仪得到的原结果怎么分析吗?具体分析步骤?

还是测心肌细胞收缩力的数据怎么分析作图?谢谢

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3 个回答

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sswei

有帮助


流式细胞检测结果根据不同图像的类型,看法不一样。

1.直方图,横坐标代表荧光信号或散射光信号相对强度,纵坐标一般是相对细胞数。

2.散点图,散点图是双变量图的,与直方图比较,其分析通量更高,因此能更好的观察到较小比例细胞群,横坐标和纵坐标都是光信号,点图上的每一个点可以代表某一个细胞的信息。

3.密度图,密度图可以表示一个标记的表达水平,而且还可以显示出固定区域中事件的相对密度。可以分为密度图、斑马线图、伪彩图。

4.等高线图,是使用等高线显示数据的相对强度,等高线图不能单独显示出低密度的群体颗粒,应该与散点图结合起来进行观察。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

一、数据采集及显示

将前向散射光检测器、侧向散射光检测器及荧光检测器收集的光信号转换成电压脉冲后,再通过模数转换器转换成为计算机能够储存处理的数字信号。流式细胞仪的数据以FSC标准格式存储,该标准由“分析细胞学协会”制定。根据FSC标准,数据存储格式应包括三个文件:样本获取文件,数据设置文件和数据分析结果。

数据采集存储完毕后,细胞亚群可以几种不同格式显示。单参数如FSC或FITC(FL1)可使用直方图,横轴表示荧光通道,纵轴表示在该通道内收集到的细胞数量。处在同一通道的每一细胞符合该通道的信号值,而且具有相同的信号密度。通道右侧信号的荧光强度明显高于左侧,越靠右侧荧光亮度越强。双参数可在二维散点图中同时显示,X轴显示通道1(FL1),Y轴显示通道2(FL2)。三维图通过X,Y,Z三个轴分别显示每个通道的细胞量。


二、设门

通过设门的方法可以定义细胞亚群的区域。如,血样本是混合细胞群,如果想单独分析淋巴球细胞,可根据FSC或细胞大小,在FSC,SSC的散点图中设门,其数据结果只反映淋巴细胞亚群的荧光特性

三、细胞亚群的数据分析

门内细胞亚群的数据结果可在随后的图中显示。我们可以通过单参数直方图,二维点图和三维图来分析结果。单参数直方图可定位边界,二维点图可设置象限标志。如果需要,还可以建立数据统计表以输出结果。

直方图可直观的显示单个参数的细胞数量。阴性对照用于决定直方图中单参数的左右边界


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loveliufudan

有帮助

以下是一般的流式细胞仪数据分析步骤:

1. 数据导入:将流式细胞仪产生的数据文件导入到流式细胞仪数据分析软件中。常用的软件包括FlowJo、FCS Express等。

2. 设置门控:根据荧光信号或散射信号的特性,设置合适的门控来筛选出感兴趣的细胞亚群。门控可以根据细胞标记物的荧光强度、大小、形状等特征进行设置。

3. 分析参数:选择要分析的参数和细胞亚群。可以根据特定的标记物来分析其在不同细胞亚群中的表达情况。

4. 统计分析:根据需要,使用适当的统计方法对数据进行分析。例如,可以计算不同细胞亚群的百分比、平均荧光强度、荧光强度的分布等。

5. 数据可视化:根据分析结果,使用合适的图表或图像来展示数据。常见的图表包括直方图、散点图、堆积柱状图等。

对于测量心肌细胞收缩力的数据分析和作图,具体的方法可能因实验设计和采集数据的方式而有所不同。一种常见的方法是使用力传感器或光学系统记录心肌细胞的收缩力,并将数据导入到数据分析软件进行处理。

具体的分析步骤可能包括:

1. 数据导入:将收缩力数据导入到适当的数据分析软件中。

2. 数据处理:根据需要,可以进行数据的平均化、滤波、校正等预处理步骤。

3. 统计分析:使用适当的统计方法计算不同组或条件下的收缩力值的平均值、标准差、显著性差异等。

4. 数据可视化:根据分析结果,选择合适的图表或图像来展示数据。常见的作图方式包括柱状图、折线图、箱线图等。


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