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大肠杆菌转化提质粒PCR有条带,酶切无条带

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dxy_tphcsz00

pet28a为载体,连接目的基因(为了对比做了两个公司的连接酶)导入大肠杆菌DH5α,挑取平板长的单菌落(平板抗性没问题),过夜摇菌提质粒,提的质粒做模板PCR验证和酶切验证,结果是PCR有目的条带,但是酶切几乎都没有目的条带,偶尔十分之一的概率可能会出现一个有目的条带的,请问这是咋回事呢(两个公司的酶做出来都是这样子的)?

是假阳性太多了吗,怎么避免呢??

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3 个回答

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高山云初

有帮助

不是假阳性太多,可能是PCR过程中太长,酶切位点发生突变

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dxy_tphcsz00user-title

你好,是

PCR时间过长了吗,我的程序是95℃预变性3分钟,变性10s,退火5s,延伸30s,35个循环,然后彻底延伸6分钟,整个循环下来大概需要1个小时25分钟。如果改的话,是不是把循环次数改小一点??




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Keven轩

有帮助

可能是PCR过程中太长,到系统紊乱,酶切位点发生突变

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dxy_tphcsz00user-title

你好,是PCR时间过长了吗,我的程序是95℃预变性3分钟,变性10s,退火5s,延伸30s,35个循环,然后彻底延伸6分钟,整个循环下来大概需要1个小时25分钟。如果改的话,是不是把循环次数改小一点??


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dxy_tsaz5wq8

有帮助

建议送测序,可能选择的酶切位点在pcr扩增过程中突变了

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