请问拿到了蛋白质TMT测序结果，如何挑选我想做的目的蛋白

1. 数据分析和筛选：仔细分析TMT测序的结果，包括蛋白质的定量和鉴定信息。通常，测序结果会提供蛋白质的相对表达水平、统计学显著性和鉴定质量等信息。根据您的研究问题和兴趣，筛选出与您关注的信号通路、生物过程或疾病相关的蛋白质。

2. 生物学功能和相关文献：对所选的蛋白质进行生物学功能注释和相关文献调研。了解这些蛋白质的功能、亚细胞定位、相互作用伙伴以及已知的生物学意义，以确保选择的目的蛋白与您的研究问题密切相关。

3. 数据验证和优先级排序：根据筛选和文献调研的结果，制定一个目的蛋白的优先级列表。考虑蛋白质的重要性、生物学功能和已有的研究结果，以及可能的实验可行性。您可以利用其他技术手段（如Western blotting、免疫组化等）对所选蛋白质进行验证，确保它们在您的研究中具有关键的功能和重要性。

4. 实验设计和进一步研究：根据所选的目的蛋白，设计适当的实验方案和进一步研究。这可能涉及到对目的蛋白进行功能研究、调控机制的探究、亚细胞定位的分析等。根据您的研究问题，确定适当的实验方法和技术来深入研究所选蛋白质的功能和作用机制。

一般是根据测序结果挑选差异较小的蛋白进行分析

从如下几个方面进行选择：

a)研究相关的文献报道，已知与该研究课题密切相关的蛋白质进行进一步的研究；

b)优先挑选蛋白质组学定量差异倍数较大的蛋白进行研究；

c)挑选鉴定到的差异蛋白中unique peptide 数量相对多的蛋白进行研究（unique peptide 数量越多，可信度越高）、

d)挑选组间平行性好的，表达趋势一致的蛋白进行进一步研究（趋势越一致，说明蛋白变化越可信）

e)结合功能分析或通路分析（生物信息学的分析范畴），筛选得到的有意义的蛋白进行研究