互作蛋白 蛋白质质谱结果分析

新手一枚，最近做了互作蛋白的蛋白质质谱结果分析，发现质谱结果里面数据库对比没有对比到我已知的a蛋白(a蛋白是诱饵蛋白)，这种结果是否可靠，公司的技术是否有问题？我现在有一点迷茫，不知道还应不应该用这次质谱的一个结果来进行后续的互作分析，求大神解答！！