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文中提到用ncbi确定蛋白是内源还是外源,外源蛋白是不是全长序列;是否是二聚体或多聚体;等,想请问有人可以分享下查的具体指引吗?

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悠木A9HT

疑问来自文中:
@vae1476:
1. 确定蛋白是内源的还是外源的,如果是外源蛋白是不是全长序列;
2. 确定蛋白质是否是二聚体或多聚体;
3. NCBI 和 SWISSPROT 查询蛋白质表达后是否有修饰,如有修饰会导致蛋白质分子量变大;
想知道怎么查呀,wb初学者的困惑🌛
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2 个回答

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wenfengzhu

有帮助
  • 内源性蛋白或外源性蛋白要看查询结果,直接在NCBI输入要查询的蛋白名称,最好为英文,看是自身表达,同源性基因表达出的为内源性蛋白,外来异物细胞免疫或体液免疫等出现的蛋白是外源性蛋白,此外,体外培养的,或者看和宿主是否有同源异质性,所谓同源性异质性物质,指同一种属的不同物质,有为内源,无为外源。从而确定是为内源还是外源,还要看它们的氨基酸组成,以及连接氨基酸的肽键,看是否有基团的末端切除或丢失,从而确定是否为全长序列,一般来说NH3和COOH之间以O=C-N-(碳氮键相连)。蛋白质的基本组成单位为氨基酸aa,2个aa相连组成二聚体,多个aa组成多聚体 。

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Eason老歌迷

有帮助

这是在回答为什么wb跑出来的条带跟目的条带大小有偏移,这个问题。

你要想在ncbi上查蛋白内外源性,可以打开ncbi,输入你想要查的蛋白,点开蛋白的具体信息,一直往下拉可以看到其他的信息如:基因信息、在染色体上的位置、表达分布、相互作用以及蛋白和mRNA的序列等。这边我把信息都隐藏只显示标签,感兴趣的可以自己点开查看而且里面的信息都能看看到引用文献。

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