寻找多个序列的直系同源序列，如何精准查确？

同源序列的查找，顾名思义就是我们要找的是和这个序列相似的序列，比如拟南芥，我们找到这个植物的一个序列，那就是把一个数据库当作比对的参照物，把这个一个拟南芥的序列与这个数据库进行比较，查看那些物种的序列和这个序列相似，这个是线上的方法，我们直接利用ncbi中的官网的方法比较blast。

首先登陆https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed，NCBI首页。点击首页下端BLAST,进入blast界面。BLAST界面提供blastn，blastp，blastx，tblastn，tblastx等选项。已知蛋白序列，查找某菌种对应的同源基因信息，点击tblastn。点击进入后，复制蛋白序列到序列框，或者“选择文件”。选择Organism。完成上述信息后，点击blast。若有多个蛋白序列需要blast，建议勾选blast按钮旁边的“新窗口显示Show results in a new window”

OrthoFinder序列的直系同源序列

打开NCBI

百度搜索键入“NCBI”，点击“搜索”，第一个就是官方主页，点击打开。

关键字查找

以H9亚型流感病毒HA基因下载为例，说明详细过程。

既然要下载基因序列，需要在栏目内找到“Nucleotide”，搜索栏内填入“Avian influenza virus H9 HA”，点击“search”。

添加限定词

点击搜索后，我们看到页面中间显示了很多关于“Avian influenza virus H9 HA”的基因序列，如果其中的一个符合你的要求，就可以下载。如何不符合你的要求，可以继续在搜索条内添加限定，比如添加“2010”，即2010年分离到的病毒。

序列选定

找到目标基因序列后，我们要将其下载下来。以给出第一个序列为例，点击序列前面的“小方格”，将其选定。

下载序列

选定后，点击页面右上角的“Send to”，选择“file”，再将format选择为“FASTA”格式，点击“Create file”，将序列下载到自定的文件夹内。

用DNAStar打开

下载的序列为FASTA格式，需要使用相关的软件打开，