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根据反转录试剂盒说明书,对所有样品添加一模一样的反转录反应体系,尤其是体积要特别注意一样,还要尽量同时加进去,再同时在pcr.仪上加热扩增。就是保证除了样品不同,其他都一模一样。
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.实验前的准备
1.1实验器具的准备:RT-PCR所用的500μl和200μl薄壁EP管、移液器吸嘴最好用进口的,因为进口EP管、移液器吸嘴已经去除了RNasin,也已经灭菌处理过,可以直接用。实验前用干净的镊子夹取出EP管、移液器吸嘴插好备用,注意镊子不要碰到EP管内壁和吸嘴的尖部。如果用国产500μl和200μlEP管和移液器吸嘴,则要提前配制0.05%——0.1%的DEPC水,将EP管、移液器吸嘴和吸嘴盒都浸泡在DEPC水中过夜后再用蒸馏水反复冲洗掉粘附的DEPC,再高压灭菌后60℃烤干备用。注意DEPC有毒,在配制及使用时应在通风橱进行,应全程带手套、口罩。
1.2试剂的准备:做RT-PCR的试剂应提前确定储备量,如试剂量不能满足一次完整的RT-PCR操作,应马上订购试剂,等试剂到了以后再做。因为RNA易降解,提取之后就应立即反转录,或在-80℃冰箱中保存,但是反复冻溶也容易使RNA降解,所以一旦RNA提取或溶解就应立即进行反转录。RT-PCR的试剂都应在冰上溶解。
1.3仪器:高速冷冻离心机、PCR仪、核酸检测仪、凝胶成相系统都应提前检查是否处于正常状态。特别是PCR仪对环境温度有要求时,应提前保证环境温度。
1.4RNA浓度测定:RNA提取后必须测浓度,记录A260吸光度及A260/A280的值,计算RNA浓度及纯度。
1.5反应体系的计算:做反转录时,根据RNA浓度计算出RNA样品的量和DEPC水的量。做PCR时,反应体系根据cDNA的样品数计算每种试剂的量,可以多计算一个(吸嘴和管壁上会粘),混后均分。反应体系的计算是非常重要的,如果出错,不但浪费试剂和样品,结果有错误,也耽误时间。
2.实验操作细节
2.1实验操作过程中必须带口罩、手套,实验室尽量避免人员干扰。
2.2RT-PCR的试剂都应在冰上融化,等完全融化后再取;用过的试剂应瞬间离心后放回-20℃保存;试剂应按顺序加,加完后再混匀离心。
2.3加入试剂前在管壁上做好标记,避免加错试剂;加过一种试剂后将EP管盖子的方向改变,避免重复和漏加;不同试剂和样品要更换吸嘴,避免污染;吸取试剂和样品前检查移液器的标数是否正确,核对正确后再取,避免浪费试剂。
2.4反应体系放入PCR仪前应检查荧光定量PCR仪的反应程序或设计新的反应程序,做PCR时循环参数应根据反
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RT过程应以相同效率反转录RNA,否则会影响qPCR的启动效率,进而带来不同的实验结果,因此对于每个RT反应应使用相同的条件。如果你需要对同一样本的多个目标进行分析时,可选择两步RT-PCR。另外,当RNA的存储是个问题时,最好是进行两步RT-PCR,因为cDNA在-20℃是稳定的。
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因为反转效率不同,产生的cdna产量就不同。可以经mrna稀释到相近的浓度,一起反转,不要有的浓度高,有的浓度低,相差太多,会导致反转效率差异,然后结果不准。
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