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要送LC/MS液相色谱-质谱检测的co-IP胶条,操作全程注意事项?

相关实验:免疫共沉淀(Co-IP)

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丁香实验

细胞裂解的蛋白co-IP、SDS-PAGE凝胶电泳后,切胶条送LC/MS检测。请问从细胞裂解到送样,在样品制备全程种有哪些注意事项?

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17 个回答

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一支肾上腺素

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注意安全,有些试剂毒性很大,特别是后面处理,每一步都要小心注意。
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红格子一号

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一般处理就行,提取注意量一定要够进行烤染或者银染,方便回收
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jey1235

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细胞裂解按照一般处理,胞浆蛋白可以温和处理,务必添加蛋白酶抑制剂。 电泳流程普通处理。全胶质谱的时候上层胶尽量做短一些。 切胶质谱可以关注目标条带位置尽量将其跑的分散一些。 切胶之前染色一下观察目标条带,确定具体位置,因为胶越窄后续越好操作。 染色之后无比保证脱色完全。除了蛋白条带被染色,空的位置尽量脱干净。 然后就是尽量切小,装ep管送去消化然后酶解等后续步骤。 ps.制胶的试剂稍微用点好的吧 或者买预制胶。确保胶没有杂质。
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dxy_h7vcp8v3

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样品切胶的时候,要戴PE手套处理,避免手上沾有蛋白酶吧蛋白质降解,其次装蛋白条带的EP管采用进口处理的EP管(因为进口EP管相应杂质含量低,不会对实验结果造成很大影响);最后蛋白条带切割下来,装进含有ddH2O的EP管,防止蛋白胶条变干。
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ZZDX-YILILI

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1.样本裂解完之后放与低温条件4℃以下,防止样本降解。 2.最开始提取样本时尽量加入蛋白酶或者磷酸酶抑制剂,尽量使用新鲜样本。
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dxy_bq4uxnd

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全程一定要规范操作,SDS- PAGE电泳时可稍微缩短一些时间,将蛋白集中于page胶的特定位置。还有co-ip注意冰上操作。
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dxy_4uyyu09r

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总结起来就两个吧,一个不能降解了,一个不能污染了,特别是后面处理,每一步都要小心注意。另外也要注意安全。有些试剂毒性挺大的。
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cathyxjjxjj

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每个条带尽量锐利使蛋白富集好切胶,蛋白量最少几微克,盐分尽量少,选择合适的酶进行酶解,脱盐尽量处理干净。
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dxy_pni5ki46

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最主要是注意避免蛋白降解,coip下来的蛋白浓度可能比较低,电泳时注意样品上样量
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飞天幻雪

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裂解正常操作就行,冰上或者4℃。加上蛋白酶抑制剂!切胶一定要记住位置,最好拍照。切胶的板一定不能有污染。用超纯水洗干净。ep管手套也都要用新的!收好样品及时放在冰上运输!
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z流沙z

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首先细胞量要足够,自己wb和coip后再送样,建议至少要用6cm皿;注意需要的对照;然后蛋白冰上提取,正常操作
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隔壁家的小夜猫子

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避免污染,更换新的跑胶液和染胶液。
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Guoood

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需要保持切胶的胶条干净无杂蛋白污染。1.电泳完纯水清洗一次。2.换用干净手套,切胶所用刀片。3.切下胶条装入EP管中,再用纯水清洗一遍,4度保存即可。
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verbalkint

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前期没有太多注意事项,就是正常裂解,正常做ip,然后跑胶的时候蛋白上样量大一些,这样考染比较容易看出来区别条带,然后切不一样的条带送去打质谱就行
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bamboopiggy

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这个问题有点太大了,你按照protocol仔细每一步操作,先做一个预实验看看,如果能染出条带,就问题,不大,如果染不出条带,可能就需要调整1. coip用的抗体,2,收样的蛋白浓度,3,跑胶时候的buffer,4染胶的考马斯亮蓝 的浓度。
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vae1476

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做过几次,需要注意的很多,捡几个重要的说一下:1.蛋白量要满足需要,需要提前预实验确定一下。2蛋白保证不要降解,尽快进行后续实验,不行的话一定要妥善保存。3注意复孔设置,样本单一不方便后续分析4预留同批次样本,以供后续验证或出现问题分析原因
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dxy_w4oj7yoe

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IP全程保持低温,选择合适的IP-buffer,不要wash体积太大,以免将很多互作蛋白洗下来。跑胶不用跑很久,大概跑到胶孔以下0.5-1 cm处就可以切条带送质谱了
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