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如果是rna病毒,一步法可以扩出片段,用反转录成cdna,再用高保真酶扩不出来片段了,这是为啥,怎么可以看cdna有没有转成功呢

相关实验:RNA 反转录

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dxy_7ne8ns9


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4 个回答

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细胞死亡

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直接测DNA浓度就可以,反转前用1ug,一般反转后也差不多。

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huarenqiang5

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考虑可能是你的高保真酶存在问题。

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loveliufudan

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如果使用一步法将RNA病毒转录为cDNA,并使用高保真酶扩增片段时出现扩增失败的情况,可能有几个可能的原因:

1. 反转录反应问题:反转录反应可能存在一些问题,如反应条件不当、反转录酶失活、核酸污染等。确保反转录反应的条件正确,使用高质量的反转录酶,并检查反应过程中是否存在污染物。

2. 引物设计问题:扩增片段的引物设计可能存在问题,如引物序列不合适、引物间相互作用等。确保引物序列与目标片段完全匹配,并避免引物之间的相互作用或二聚体形成。

3. 目标片段问题:目标片段本身可能存在结构变异、限制性酶切位点、RNA修饰等问题,导致无法成功扩增。确保目标片段的完整性和合适性,检查是否存在限制性酶切位点或其他结构特征。

为了验证cDNA是否成功转录,您可以尝试以下方法:

1. 聚合酶链反应(PCR):使用转录后的cDNA作为模板,设计适当的引物进行PCR扩增。如果扩增出预期的片段,则表明cDNA转录成功。

2. 凝胶电泳:将扩增产物进行凝胶电泳分析,观察是否出现目标片段的带状条带。如果出现与预期大小相符的条带,则表明cDNA转录成功。

另外,如果一步法转录反应失败,您还可以尝试使用两步法进行反转录和扩增。在两步法中,先进行反转录反应得到cDNA,然后使用这些cDNA作为模板进行扩增。这种方法可能提供更高的扩增效率和特异性。

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土井挞克树

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可以做cdna电泳检测看cdna是否转成功

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dxy_7ne8ns9user-title

直接对cdna跑电泳吗

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