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为什么在设计shRNA的时候,要在前面加G,看到好多都是确保RNA聚合酶转录,到底是怎么发生的呢

相关实验:shRNA 设计

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dxy_1gj3oac9

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3 个回答

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Dr_劉医生

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shRNA是一种RNA干扰技术,它可以通过靶向mRNA来抑制基因表达。在设计shRNA时,加入G可以增加shRNA的稳定性和效率。这是因为G可以形成一个三联碱基GNN,这个三联碱基可以增加shRNA的稳定性和效率。

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土井挞克树

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因为G的稳定性最好,有利于转录,而其他碱基的稳定性差

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loveliufudan

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在设计 shRNA(short hairpin RNA)的时候,在 shRNA 的5’端加上 G 的目的是为了确保 shRNA 能够被 RNA 聚合酶II转录,因为 RNA 聚合酶II 在转录 RNA 的时候需要一个 guanine (G) 核苷酸作为起始信号。如果 shRNA 的5’端没有 G,可能会导致 RNA 聚合酶无法将其转录,从而影响其表达和下游实验的结果。

另外,还有一些研究表明,加上 G 在 shRNA 的5’端也可以增加 shRNA 的稳定性,降低其被核酸内切酶(nucleases)降解的速度。

需要注意的是,虽然加上 G 可以提高 shRNA 的转录效率和稳定性,但是设计 shRNA 时需要避免 GGG 的重复序列,因为这可能会形成细胞毒性的 DNA 序列,从而影响实验结果。同时,shRNA 序列的设计也需要考虑目标基因的靶向性和特异性,以及对于非靶向基因的干扰程度等因素。

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