GEO数据库提取lncRNA

相关实验：总 RNA 提取实验

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海狸先生乀

2022-10-24

从TCGA提取的lncRNA在GEO数据库中找不到而且TCGA数据库有些lncRNA是以A开头然后一堆数字比如AC006160.1. GEO则有些是LOC100049716 没办法对应。尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应，但能筛选出的lncRNA很少且不全，请问各位大神，有什么其他办法能筛选出lncRNA呢？还是利用ensembl号对应有什么需要注意的地方呢，万分感谢！！

2 个回答

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地下河9QNE

2024-04-29

有帮助

你好，问题解决了吗，我遇到了同样的问题

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土井挞克树

2022-10-24

有帮助

一般不用ense号，直接提取之后自己去对应一下试试

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