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GEO数据库提取lncRNA

相关实验:总 RNA 提取实验

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海狸先生乀

从TCGA提取的lncRNA在GEO数据库中找不到 而且TCGA数据库有些lncRNA是以A开头然后一堆数字 比如AC006160.1. GEO则有些是LOC100049716 没办法对应。尝试从GENCODE网站下载全部lncRNA的信息用ensembl号进行对应,但能筛选出的lncRNA很少且不全,请问各位大神,有什么其他办法能筛选出lncRNA呢?还是利用ensembl号对应有什么需要注意的地方呢,万分感谢!!

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2 个回答

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地下河9QNE

有帮助

你好,问题解决了吗,我遇到了同样的问题

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土井挞克树

有帮助

一般不用ense号,直接提取之后自己去对应一下试试

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