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lncRNA 的生物功能
lncRNA作用范围广泛,机制非常复杂,为了方便大家的理解,我们来简单看看lncRNA的特点:
1. 在编码蛋白基因的上游启动子区转录,干扰邻近蛋白编码基因的表达
2. 与编码蛋白基因的转录本形成互补双链,调控基因的表达水平
3. 结合在特定蛋白质上调节相应蛋白的活性
4. 作为小分子RNA的前体分子或者miRNA反义抑制分子
5. 作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体
lncRNA的功能研究
lncRNA研究中非常关键的一步就是发现特定的lncRNA,通过高通量测序筛选候选lncRNA是一种准确快捷的方法。lncRNA测序分析主要分为三步:
利用探针去除核糖体
目前针对研究较多的人、大鼠、小鼠,推荐使进行高效核糖体去除,去除后利用qPCR验证rRNA去除效率,通常要求rRNA去除率高于90%
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lncRNA既能和DNA、mRNA还能和蛋白质相互作用,其作用机制包括:(1)直接与编码基因启动子区结合;(2)介导组蛋白修饰、染色质重构;(3)调控mRNA前体的可变剪接,或形成内源性siRNA分子;(4)调控转录因子活性或募集转录调控因子至启动子区,调控靶基因转录;(5)改变转录因子的亚细胞定位或作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体,进一步调节转录或调控蛋白活性;(6)作为小分子RNA的前体参与基因调控;(7)作为miRNA海绵,与miRNA靶基因竞争性结合,解除miRNA对其靶基因的抑制作用,升高靶基因的表达水平。
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通过表观遗传调控、转录调控及转录后调控参与蛋白编码基因的调控
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