RNAi 和PRISPR对比，哪个技术更好呢？

RNAi与CRISPRi的主要区别在于其发挥沉默基因功能的水平不同：

RNAi技术是通过双链RNA（double-stranded RNA，dsRNA）诱发同源RNA高效特异性降解，从而导致基因沉默，其作用位置为细胞质，相对更适用于mRNA，优点是技术成熟，操作简单。

而CRISPRi技术是能抑制指定目标的转录，不论是编码还是非编码的DNA片段。CRISPRi使用催化失活的Cas9（dCas9），dCas9能到达引导RNA指定的位点，但无力对DNA进行剪切（Cell, 152:1173-83, 2013）。当dCas9结合到基因组的时候，会阻断转录机器的结合，阻止这一过程的进行。因此这一技术的的干扰效率更高且脱靶风险更低，并且更适用于一些在细胞核内发挥功能的非编码RNA研究。

个人认为后者更好一些。RNAi 是一种基因下调方法，但并不能完全去除基因的功能。而CRISPR是在引导 RNA 的指导下，与目的核酸片段进行靶向结合并进行切割。此外，尽管 RNAi 和 CRISPR 均存在脱靶问题，但由于CRISPR脱靶效率要远低于RNAi。

RNAi和CRISPR/Cas9的筛选精确性都很高。不过这两种技术筛选出来的基因并不相同，而且CRISPR鉴定出的必需基因更多。

多功能的CRISPR技术让一系列的基因修饰（CRISPR-KO、CRISPRi和CRISPRa）得以实现。

因此，它已取代RNAi成为首选的功能基因组筛选工具CRISPR基因敲除的效率以及高特异性和低背景，与RNAi形成了鲜明对比。RNAi的优势在于依靠内源性RNA沉默机制，因此在操作上是最简单的方法。

目前，基因干扰方面应用最广泛最成熟的还是短发卡RNA（shRNA）介导的RNAi技术。过去十几年，RNAi一直是基因功能研究尤其是功能基因组学筛选的首选方法。但是CRISPR技术的横空出世，凭借着更低的脱靶效率，更高的干扰水平，因此通常，CRISPRi拥有比RNAi更高的干扰效率和更低的脱靶风险，在基因干扰能力上显著优于传统的RNAi技术。