对于靶基因的干扰实验，shRNA和siRNA该如何选择？

siRNA和shRNA之间进行选择时，要考虑的一个重要因素是实验时间的长短。 siRNA在细胞中瞬时表达的，通常在3-5天内进行检测，而shRNA可以通过病毒或质粒介导的转染保持稳定。

如果只是补个数据，果断用siRNA。如果建立起稳定细胞体系以后还有很多实验，建议用shRNA，原代细胞不容易转，而脂质体转染效率不高，所以我很担心您实验的成功率。我建议您换一种转染试剂。我们实验室现在用的是英格恩生物的转染试剂R4000，专门针对RNA转染，原代细胞、悬浮细胞和敏感细胞都可以转，而且他家的试剂是纳米材料的，效果优于脂质体，可以试一下。

原代细胞一般是从活体组织中*的细胞，细胞体系比较复杂，不稳定，原代培养具有两个特点接触抑制和贴壁生长，原代细胞的转染要比一般传代的细胞难很多，BIODAI可以转染siRNA、antisense RNA、microRNA等200bp以内的小分子RNA和DNA。

质粒的转染效率跟siRNA类似，不过shRNA被表达出来需要时间，所以效果可能没有siRNA直接快速。

但是shRNA质粒一般含有抗生素选择基因，这就允许你筛选稳定细胞系，不过这个很花时间（1-3个月）

不过一旦稳定细胞系筛选成功，你就再不用做转染实验了，一劳永逸。

所以两者各有所长，要看你的实验性质。