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H9C2心肌细胞提取RNA电泳多一个条带

相关实验:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)

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efoda

从心肌细胞中提出来的RNA跑核酸电泳发现 28s条带上方有条浅浅的条带,请问可能是什么原因呢?



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5 个回答

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晓雨知春来

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可能是RNA降解或DNA污染造成的。

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28s RNA条带上方和电泳孔处有条带,说明有蛋白和gDNA污染

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huarenqiang5

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考虑可能是DNA 小片段的残留或样品的长时间保存或样品过量所致。

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loveliufudan

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从H9C2心肌细胞中提取的RNA样品核糖体RNA电泳出现28S rRNA上方有一条额外的浅条带,可能的原因有:


1. RNA降解,28S RNA发生降解,生成大小稍小的降解产物。需用RNase抑制剂和在低温下操作。


2. DNA污染,染色体DNA进入样品,其部分片段处在28S附近位置。需要再次提纯或DNA酶处理。


3. 核糖体RNA异常剪切,生成一种28S的异构体rRNA。这种情况较少见。


4. 蛋白质污染,有RNAs结合蛋白进入样品,可能会影响迁移。需再次提纯或蛋白酶K处理。


5. 上样量不均匀,过量上样导致条带上移运行不集中。需优化上样量。


6. 凝胶浓度或碳酸钠含量不正确,使条带隔离不佳。需优化凝胶配方。


初步判断这可能是RNA降解或DNA污染造成的,需要从样品操作和测序环节找出原因。如果问题持续,也可以考虑心肌细胞本身异常剪切的可能。

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土井挞克树

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考虑是rna存在降解产生的降解条带。

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