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做土壤微生物的,需要定量检测土壤中某一真菌的生物量。

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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东风吹过小西北

实验目的需要检测土壤中单独一种真菌的生物量,能否设计某种引物通过qpcr来特异性定量检测其dna含量,从而定量检测其生物量。如果可以的话,整个实验的难点在哪里,最耗时的是哪一块,整个实验步骤大概是怎样的。

 

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4 个回答

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是TTT

有帮助

能够设计该种真菌特异性表达产物的引物,通过qpcr来特异性定量检测其dna含量,从而定量检测其生物量。

整个实验的难点可能在于样品的提取,qpcr按照试剂盒说明书做即可

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loveliufudan

有帮助

可以通过设计特异性引物并使用qPCR技术来定量检测特定真菌的DNA含量,从而推测其生物量。具体的实验步骤大概如下:

首先需要收集士土样品,将其进行粉碎和筛选,以获得较为均匀的样品。

提取士土样品中的真菌DNA,可以采用商用的DNA提取试剂盒或自制方法。

设计特异性引物,需要通过生物信息学方法从已知真菌的基因序列中筛选出比较保守的区域,并进行引物设计和验证。

进行qPCR反应,将提取到的真菌DNA和特异性引物一起进行PCR扩增,并使用荧光探针或SYBR Green等荧光染料进行检测和定量。

利用标准曲线法或相对定量法计算出样品中真菌的DNA含量,从而推测出其生物量。

整个实验的难点在于引物设计和验证,需要通过多种方法来确保引物的特异性和灵敏度。最耗时的部分可能是样品处理和DNA提取,以及引物的优化和反应条件的确定。

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沫子大大

有帮助

可以通过设计特异性引物和使用qPCR技术来定量检测土壤中单独一种真菌的DNA含量,从而间接地推断其生物量。这种方法被称为qPCR定量法或定量PCR。其基本原理是利用PCR技术扩增目标DNA片段,然后通过荧光探针或染料来定量检X而推算出样品中目标DNA的含量。

整个实验的难点在于1.引物的设计:需要根据目标真菌的特异性序列设计引物,确保引物与其他物种的DNA不发生交叉反应,同时能够高效特异地扩增目标真菌的DNA。2.样品的处理:由于土壤样品中存在大量的其他微生物和有机物,需要进行活当的外理来处化目标真菌的DNA并去除干扰物质3.qPCR反应条件的优化: 需要对PCR反应条件进行优化,包括引物浓度、PCR反应体系、PCR程序等以确保PCR反应的高效性和特异性。4.数据分析:需要对qPCR数据进行分析和解释,包括确定目标真菌的DNA含量,计算其生物量等。

在整个实验中,样品处理和qPCR反应条件的优化可能是最耗时的部分。一般的实验步骤包括

1.提取土壤样品中的DNA,并进行纯化和浓缩。2.设计并合成特异性引物。3.优化qPCR反应条件,包括PCR体系的优化和PCR程序的设置。4.扩增DNA片段并用荧光探针或染料定量检测PCR产物的数量。5.计算目标真菌的DNA含量,并推算其生物量。需要注意的是,实验过程中需要采取一系列的对照实验来验证实验的可靠性和准确性,包括PCR阴性对照、标准曲线建立等。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

可以通过设计某种引物通过qpcr来特异性定量检测其dna含量,从而定量检测其生物量。难点在于特异性引物的选取

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