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qPCR重复性和结果处理

相关实验:逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR,rtpcr)

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1、qPCR实验重复性是指一次实验复孔4个,在同一96孔板上重复3次,即每个细胞每个基因做12个孔。还是一次实验复孔4个,每个细胞每个基因做4个孔,重复做3天。(最后去掉差异大的复孔的CT值)
2、结果处理:①计算时是同时计算3次独立实验的2-ΔΔCT值,然后3次独立实验做成一张图;还是每次独立实验都分开计算,做3张图。②计算时是所有数据的3个复孔CT值取平均值,然后再计算
2-ΔΔCT;还是直接算,不取平均值。

3、我现在的问题:我现在用的是一次实验复孔4个,每个细胞每个基因做4个孔,重复做3天。3次实验的2-ΔΔCT差的有点大,有时候相差4倍左右,但是趋势相同、都比对照组高,这个实验结果可以吗?

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3 个回答

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bamboopiggy

有帮助

1、实验性重复,是指每次实验,每个样品,针对每个基因要有最少三个复孔。不用12个,也不用重复三天。

2、①这个都可以,看你想怎么处理。

3个复孔取平均值。

3、你的实验结果可以,但是太费了,你只要做3个复孔,做一天就可以。

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Eason老歌迷

有帮助

问题一,qPCR实验重复性是一次实验复孔4个,每个细胞每个基因做4个孔,重复做3次。问题二:①计算时是同时计算3次独立实验的2-ΔΔCT值,然后3次独立实验做成一张图。②计算时是所有数据的3个复孔CT值取平均值,然后再计算2-ΔΔCT。

跑出来趋势相同、都比对照组高,这个实验结果可以。

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whilt-shirt

有帮助

重复一般是一组重复做3个以上样本,然后跑qPCR时一个基因做3个以上复孔。看你的描述,这个结果是可以用的

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