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大肠杆菌逆转录可以使用oligoDT吗,我的表达基因上有连续的a,能否使用oligoDT,然后做qpcr

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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dxy_gyip6fl9


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3 个回答

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汤姆卜丽波

有帮助

可以做的,能p出来,只要有一点表达都能p出来

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loveliufudan

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您的表达基因上有连续的A,说明您可能是在大肠杆菌中表达了一个带有poly(A)尾的外源基因。在这种情况下,您可以尝试使用oligo(dT)引物进行逆转录。

使用oligo(dT)引物进行逆转录的步骤如下:

RNA提取:从转化后的大肠杆菌细胞中提取总RNA,可以使用RNA提取试剂盒或经典的酚氯仿提取法。

RNA纯化:为了消除RNA中可能存在的DNA污染,请使用DNase I对RNA样品进行处理。

RNA定量:使用NanoDrop或类似设备对纯化后的RNA进行定量,并评估其纯度和完整性。

逆转录反应:使用oligo(dT)引物和逆转录酶(如M-MLV、SuperScript III等)按照厂商建议的方案进行逆转录反应。在逆转录反应中,oligo(dT)将结合到mRNA的poly(A)尾,并作为反应的起始位点。

qPCR:逆转录反应完成后,将产物用于qPCR实验。设计特异性引物靶向您的目标基因,然后使用合适的qPCR试剂盒和实时PCR仪器进行qPCR。

请注意,虽然可以尝试使用oligo(dT)引物进行逆转录,但是原核生物的mRNA不稳定性可能导致结果偏低。您可以考虑使用针对您目标基因特异性的随机引物,以便更准确地评估目标基因的表达水平。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

大肠杆菌逆转录可以使用oligoD的,表达基因上有连续的a使用oligoDT可能会降低成功率,但是也可以用然后做qpcr。

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