旋毛虫干预下细菌性肠炎小鼠的症状及肠道菌群丰度变化的实验设计该怎么设计？

做qPCR，可以定量对比玄毛虫干预和不干预，小鼠肠道菌群丰度的差异

炎症因子的话，也可以用qp去做，可以提取小鼠肠道组织RNA，当然也可以用elisa试剂盒检测

可以用16sRNA荧光定量PCR，对于相关因子的测定，可以购买相应的ELISA试剂盒进行检测

实验设计：

（1）小鼠分为正常组、模型组、旋毛虫组和干预组。其中模型组给予细菌性肠炎诱导剂诱导肠炎，旋毛虫组在模型组的基础上感染旋毛虫，干预组在模型组的基础上同时给予旋毛虫干预剂。

（2）观察小鼠的症状和粪便形态，记录体重变化情况。

（3）采集小鼠的粪便样品和肠道组织，提取DNA并进行16S rRNA基因扩增和测序，利用生物信息学方法分析肠道菌群丰度和群落结构的变化。

PCR操作：

可以采用通用的16S rRNA基因扩增引物对样品进行PCR扩增，如27F和1492R。PCR反应体系可根据具体试剂盒和仪器调整，一般包括模板DNA、引物、dNTPs、Taq聚合酶、缓冲液和水。

ELISA法操作：

（1）制备标准曲线：取各浓度的标准品，分别加入孔中，加入检测抗体和酶标记二抗，最后加入底物，测定OD值，用标准曲线计算样品中细胞因子的浓度。

（2）处理样品：取小鼠肠道组织样品，加入磷酸盐缓冲液，超声裂解。离心后，将上清加入试剂盒提供的板孔中。

（3）加入检测抗体和酶标记二抗：加入检测抗体混合液，孵育后洗涤，加入酶标记二抗混合液，孵育后再次洗涤。

（4）加入底物：加入底物，孵育一定时间后加入终止液，测定OD值，用标准曲线计算样品中细胞因子的浓度。

用荧光定量pcr或者普通pcr都可以，测免疫因子可以取肠道组织做elisa和pcr