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STR引物设计如何开始呢?

相关实验:PCR 引物设计及评价实验

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哦吼吼吼321

在NCBI里查找STR,有的STR有引物,对于没有引物的STR,是不是查找出该序列后再设计。如果如果针对该序列进行设计,那么pcr产物就肯定没有包括这个STR位点的整个序列。

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2 个回答

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天一湖医者

有帮助

引物以18~30bp为宜;引物中C+G含量宜在50%左右;引物内部和引物之间不应含有互补序列;引物的碱基顺序与非扩增区域的同源性应小于70%;引物的3’末端与模板DNA一定要配对,但末端没有严格的限制,故引物设计时可在5’末端加上限制性内切酶位点和/或启动密码ATG等;引物合成后必须纯化以去除合成产物中的不完整序列、脱嘌呤产物、碱基修饰链等“杂质”;引物的终浓度一般为0.2~0.5μmol/L,过低会影响反应产量,过高会增加引物二聚或错配的几率。

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洛噜啦噜啦嘞

有帮助

有的STR有引物应该是进过验证的,还是比较可信的,自己设计的话就像你说的,有可能效果不好,另外推荐个STR的网站供参考:http://www.cstl.nist.gov/div831/strbase/index.htm

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