多重PCR可以分开做吗？十六对引物就做十六孔，都是同一次逆转的cDNA，然后一起扩增

可以的 可以的，只要你不嫌麻烦，这个完全是可以的。但是他不就失去多重pcr意义了吗

不可以，多重PCR是不可以分开做的。

如果是要样品或者组别之间进行比较最好一起做或者至少每次做都有可以相互比较的组别。

你分开做的话就不是多重PCR了，只是一个普通的PCR