天一湖医者
造成qPCR实验重复性不好的原因有以下几点:
① 移液枪不准,加样不准确
这种情况下,我们可以更换性能更好的移液枪,扩大反应体积,将模板做高倍稀释,以大体积加入反应体系中
② 定量PCR仪在不同位置温度不一样
这个需要定期校准定量PCR仪
③ qPCR预混液未混合均匀
使用前应充分混匀qPCR预混液
汤姆卜丽波
同一实验设计的所有样本需取材部位/时间完全一致。选取大小均一,生长条件和遗传背景一致的供试材料。 同一种处理严格按照实验设计,处理剂量一致。
起始样本量尽量一致,不要超过试剂盒规定的范围。
把控RNA提取的整个流程,防止RNA降解。
跨外显子设计定量引物,使基因组序列不被扩增。
选用具有去除基因组功能的RNA提取试剂盒。
选用具有去除基因组功能的反转录试剂,消除基因组的影响。
倍比稀释cDNA模板减少PCR抑制剂的影响。
采用适宜的离心柱法试剂盒提取RNA,以提高RNA纯度。
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加样前混匀cDNA,用好一点的枪和枪尖。
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重复性差的原因有:
1)加样误差导致,建议移液器定期校准,另外可通过扩大反应体系或提前配制好预混液优化。
2)模板量低,建议提高模板量,使Ct值落在15-30之间。
3)仪器长时间未校准,建议定期进行仪器校准保养。
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