设计好的引物如何在NCBI 上比对?

引物比对在ncbi主页www.ncbi.nlm.nih.gov/上点blast，然后选择左上角那个版块里的search for short，nearly exact matches，输入上游引物序列，在下一行输入下游引物序列，选择你要看的种属（没有特殊要求就选择nr），点submit，在下一个窗口中点format，就可以了。 这样是看一对引物的特异性。

http://primer3.ut.ee，在这里，第一个框选check primers 就可以比对

NCBI主页，主页最下面选择primer-blast，里面输入自己的设计的引物（正向和反向），然后下面database选择genome（chromosomes from all organisms），roganism选择你要研究的组织，比如检测人是否有乙肝病毒，组织就选择人了。然后点后面get primers 。稍等片刻，就出来相应结果。

登陆ncbi主页,点击nucleotide,点击网页左侧blast,然后选择Nucleotide-nucleotide BLAST (blastn) 或Search for short, nearly exact matches都可以,在空白诓输入您的序列,种属限定为您所需要的,点击submit就可以了. 上下游分开比对!祝试验顺利!

在界面主下方单击primer blast,之后在primer parameter下面上下引物栏里分别输入你的上下引物，在organism栏里输入你所想要的物种，然后单击get primer