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q-PCR有非特异性条带有没有办法在设计引物的时候提高特异性?

相关实验:实时荧光定量 PCR(realtime PCR)

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王建勇

我要检测的mRNA在细胞中丰度很低,每次设计的引物做PCR的手都有非特异性条带,我用的是染料法biorad的ssofast,不知道有没有方法改善特异性。请大家帮帮忙。
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8 个回答

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健坤免疫组化

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现在常用的引物有染料法(sybr green 1)和探针法(taq man探针),taq man探针的特异性非常,但是价格要贵一些,而sybr green 1价格比较便宜,但是会有非特异性扩增,建议试试taq man探针,详细还可参考:http://www.biomart.cn/infosupply/27646868.htm
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敬畏OK

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GC含量高,说明解链温度高,目的条带在较高温度才会解链,而在未达到解链温度时,引物会以未完全解链的DNA为模板,进行PCR非特异性扩增,所以易出现非特异性条带。
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zhangh111

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可能是引物设计有问题
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紫杉醇916

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是不是退火温度太低,所以容易出现非特异性条带。
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alaling

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一个尽快提高特异性的方法:用Taqman的探针法……目前来看是最特异的方法了,与其在这耗着不如多花点钱。如果这个方法都不行,干脆放弃吧,方法层面都走不通。

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200210lee

有帮助
楼主已经是用的real time 了"染料法biorad的ssofast"..... 楼主先确定非特异性产物究竟是什么,什么来源。引物2聚体,基因组扩增的产物还是真正cDNA的非特异产物。引物2聚体,可以调下扩增条件,实在不行换引物就好。基因组污染的话,保证RNA质量,引物设计时注意跨过内含子。其他的换引物吧。
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sarinmd

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换real time吧,耗这么多时间不划算
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苏格兰白草莓

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如果拿来做一般的PCR都还是有杂带的话,且丰度低,那还是换探针法为好
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