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讨论某基因表达量,发现在A事件的基因表达量显著高于B事件,进一步研究,想看在该基因低表达的情况下是否更倾向于发生B事件,不知道应该用什么作图方式,目前算事件发生频率可以知道是B事件在低表达的时候发生率高,但不知道用什么图合适。通过比较pvalue的值吗?
晓雨知春来
建议可以使用条形图,这样比较直观一点。
汤姆卜丽波
用柱状图比较P值,这样比较合适
loveliufudan
建议可以使用条形图比较不同基因表达水平下事件发生频率的方法进行可视化表达。
1. X轴为该基因的表达水平,分为高表达和低表达两组。
2. Y轴为A事件和B事件发生的频率或百分比。
3. 每个组里分别绘制A事件和B事件的条形图,并在条形图上标明具体频率或百分比。
4. 对比高低表达两组里A、B事件发生频率的变化。
5. 在图中加入统计判断,用星号标明高低表达组间差异的显著性水平。
6. 可以添加一张该基因在高低表达样本中的原始检测结果图,呈现基因表达水平的对比。
这种可视化的条形图可以直观地呈现基因表达变化与事件发生频率之间的关联,并用统计学支持其显著性。
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