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小白发问,SSR设计引物为什么要设计多对引物啊,设计出来的多对引物是可以全基因组的所有SSR位点都扩出来,还是说只能扩出

相关实验:SSR 标记实验步骤

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啥也不会的烂仔


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3 个回答

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晓雨知春来

有帮助

可以把全基因组的所有SSR位点都扩出来。

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啥也不会的烂仔user-title

那请问一下,全基因组有那么多的ssr位点,是要一个一个的去设计吗?还是说可以设计出一套通用的来用?因为是按照ssr两侧序列去设计的,所以不同的ssr两侧序列不同吧?

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loveliufudan

有帮助

设计多对引物时,需要考虑以下因素:

1. 引物特异性:确保引物只扩增目标SSR位点,而不扩增其他非特异位点。

2. 引物长度:适当控制引物长度,通常在18-25个碱基对之间,以提高扩增效率和特异性。

3. 引物间距离:设计引物时,尽量使引物对之间的距离较远,以覆盖更多的位点。

4. 引物GC含量和熔解温度:引物的GC含量和熔解温度要适中,以确保扩增反应的稳定性和特异性。

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毛利小五郎的徒弟

有帮助

多对引物可以把ssr位点都扩出来。

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啥也不会的烂仔user-title

大佬,我想问一下设计这个引物的时候不是根据一个ssr位点的两侧序列去设计的吗,按道理不是只能扩增出这个ssr吗,为什么说其他的ssr都能扩增啊?基因组有这么多的ssr,还是说每个ssr位点都需要单独去设计啊?


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