目的基因对下游影响

考虑目的基因对下游信号有双重调节，建议固定实验条件后先探索一条通路。

在目的基因敲减后，您观察到下游蛋白和mRNA的变化。这可能意味着目的基因的敲减对信号通路或基因调控产生了影响，进而导致了这些变化。

下游蛋白变化的解释：

1. 目的基因的敲减可能导致该基因编码的蛋白在数量上发生变化。如果目的基因编码的蛋白是一个调节因子或信号传导分子，其敲减可能会影响下游蛋白的表达或稳定性，从而导致变化。

2. 目的基因的敲减可能影响细胞内的代谢途径或蛋白质合成/降解机制。这可能会影响下游蛋白的表达水平或翻译后修饰，从而引起变化。

下游mRNA变化的解释：

1. 目的基因的敲减可能直接或间接地调节与下游mRNA相关的转录因子或转录调控因子。这可能导致下游基因的转录水平发生变化，进而影响mRNA的表达。

2. 目的基因的敲减可能改变细胞内的信号传导路径或代谢途径，从而影响下游基因的表达。这种变化可能是通过转录因子或其他调控因子的激活或抑制来实现的。

综上所述，您的研究结果表明目的基因的敲减对信号通路和基因调控产生了影响，导致下游蛋白和mRNA的变化。这些结果提供了关于目的基因在细胞内功能和调控网络中的作用的线索。

为更全面地理解结果，您可以进一步探索目的基因及其调控的信号通路和分子机制。您可以考虑通过功能富集分析、基因表达调控网络分析等方法，来识别目的基因敲减引起的生物学过程或通路的变化。此外，验证下游mRNA和蛋白质变化的功能和相互作用，可以通过其他实验技术（例如功能敲减、过表达、细胞功能和途径分析等）进一步确认和解释。